新的CRISPR工具靶向哺乳動物細(xì)胞中的RNA
麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)廣泛研究所的研究人員表明,基于CRISPR的編輯系統(tǒng)可以切割和結(jié)合哺乳動物細(xì)胞中的RNA。本周在“自然”雜志的一篇論文中,研究小組使用CRISPR-Cas13(研究人員幫助發(fā)現(xiàn))降低RNA水平和“標(biāo)記”RNA,以便在細(xì)胞內(nèi)觀察和追蹤它們。研究人員之前使用CRISPR-Cas13靶向細(xì)菌細(xì)胞中的RNA,但證明該系統(tǒng)可以在哺乳動物細(xì)胞中安全有效地工作,這是使用該系統(tǒng)研究人類生物學(xué)和疾病的關(guān)鍵一步。
擁有這種用于調(diào)節(jié)哺乳動物細(xì)胞中RNA的可編程工具,為學(xué)習(xí)細(xì)胞如何發(fā)揮作用創(chuàng)造了新的機(jī)會,并有可能為設(shè)計更安全的治療方法。不像編輯DNA,它會對細(xì)胞基因組進(jìn)行永久性改變,靶向RNA可以使研究人員進(jìn)行臨時改變,改變基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì)量,而不是完全停止生產(chǎn)。
“即使我們有很好的工具來刪除基因,它們?nèi)杂泻芏嗑窒扌裕够蚬δ苎芯孔兊美щy,”共同第一作者Omar Abudayyeh解釋說,他是Broad核心成員和麻省理工學(xué)院副教授的研究生。馮章“Cas13允許你降低基因表達(dá)水平而不完全消除它們,這對于研究基因很有用,并且可能提供一種毒性較小的治療方法來糾正遺傳性疾病。”
由張氏實驗室的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的研究小組測試了來自15種不同微生物的Cas13酶,以找到最適合該任務(wù)的Leptotrichia wadei(LwaCas13a)。使用LwaCas13a使他們能夠切割目標(biāo)RNA中的特定位點,其特異性高于當(dāng)前RNA-knockdown選擇工具RNA干擾(RNAi)。盡管RNAi可能是一種有用的工具,但它往往會導(dǎo)致不必要的脫靶效應(yīng),使實驗難以解釋。Cas13顯著降低了這種脫靶效應(yīng)。
Zhang的研究小組還證明,Cas13結(jié)合RNA但不切割它的所謂“死亡”變體可以與明亮的熒光“標(biāo)簽”結(jié)合,以便在細(xì)胞內(nèi)移動時可視地跟蹤目標(biāo)RNA。
“我們在這里設(shè)計的Cas13工程用于綁定和成像轉(zhuǎn)錄本,顯示了該平臺對開發(fā)更廣泛的監(jiān)測和操作RNA工具的承諾,”共同第一作者Jonathan Gootenberg補(bǔ)充道,他也是張氏實驗室的研究生。以及Broad核心成員Aviv Regev的實驗室。
研究人員指出,CRISPR-Cas13天然結(jié)合RNA的能力也使其比其他技術(shù)更容易使用,目前需要研究人員修改生物體的基因組以創(chuàng)建結(jié)合位點。這些特征可以使CRISPR-Cas13成為生物學(xué)家研究基因功能工具箱的重要補(bǔ)充;研究人員可以通過非營利性質(zhì)粒庫Addgene獲得CRISPR-Cas13工具。
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