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        通過環(huán)境DNA識別物種
        
			
        
				2019-05-05 10:58:00
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        環(huán)境DNA分析可以檢測水生物，而無需先捕獲它們。慕尼黑技術(shù)大學(xué)(TUM)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)首次系統(tǒng)地研究了各種環(huán)境因素對環(huán)境DNA分析的影響。通過這樣做，研究人員向該方法的標(biāo)準(zhǔn)化應(yīng)用邁出了重要的一步，用于監(jiān)測水體。
        

        通過環(huán)境DNA識別物種
        

        可以使用分子分析檢測動物釋放到水生環(huán)境中的DNA。該檢測方法稱為使用水樣的環(huán)境DNA(eDNA)。然而，該方法在所有水體中不能同樣良好地起作用，因此很可能受到每個(gè)水體中各自條件的影響。這可包括水中的有機(jī)和無機(jī)組分或流動條件。到目前為止，幾乎沒有研究個(gè)體因素對分析程序的影響程度。
        

        來自TUM水生系統(tǒng)生物學(xué)和分子動物學(xué)部主席的研究員Bernhard Stoeckle博士和Sebastian Beggel博士研究了實(shí)驗(yàn)中各種環(huán)境因素對eDNA分析的影響。該實(shí)驗(yàn)的想法是基于先前對本地貽貝物種的eDNA研究。
        

        在系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室設(shè)置中，屬于入侵物種的魚 - 圓形蝦虎魚(Neogobius melanostomus) - 在不同的流動條件下，在有和沒有沉積物的情況下，以不同的密度保存在水族箱中，并在規(guī)定的時(shí)間段后從水中移除。時(shí)間。
        

        隨后，研究人員在六天的時(shí)間內(nèi)定期取水樣，以便能夠評估eDNA分析隨時(shí)間的效率。此外，研究人員還添加了幾種物質(zhì)，這些物質(zhì)可能會阻礙分子分析，如藻類，腐殖質(zhì)和無機(jī)懸浮顆粒，這些物質(zhì)也存在于自然生態(tài)系統(tǒng)中。
        

        “這一點(diǎn)尤為重要，否則我們無法將這些發(fā)現(xiàn)應(yīng)用于該領(lǐng)域的eDNA研究，”Bernhard Stoeckle解釋說。為了找出哪些因素影響最大，研究人員然后將所有水樣的eDNA結(jié)果進(jìn)行了比較。
        

        因素的影響程度隨時(shí)間而變化
        

        一方面，實(shí)驗(yàn)評估表明，在整個(gè)持續(xù)時(shí)間內(nèi)，流動條件，沉積物的存在與否以及魚類密度僅相互結(jié)合對分析產(chǎn)生影響。另一方面，事實(shí)證明，因素的影響程度隨著時(shí)間的推移而發(fā)生了很大變化。
        

        在添加的抑制劑中，有機(jī)物質(zhì)(腐殖質(zhì))干擾分析最多。它們通常完全排除了該方法的成功應(yīng)用。只能在41%的檢測樣本中檢測到DNA。藻類也有相似的效果，盡管不太明顯。“我們的研究結(jié)果清楚地表明，在進(jìn)行eDNA分析時(shí)，為了能夠正確解釋結(jié)果，環(huán)境條件也被考慮在內(nèi)是多么重要，”Bernhard Stoeckle說。
        

        根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果，可以得出結(jié)論，特定的環(huán)境條件極大地干擾了環(huán)境DNA實(shí)驗(yàn)，在某些情況下使得檢測物種變得困難甚至不可能。
        
			

			
          
        
			
        
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