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        尋找海底總動員的基因
        
			
        
				2019-03-22 15:38:36
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        一個(gè)國際研究團(tuán)隊(duì)繪制了Nemo的基因組圖譜，為研究界提供了寶貴的資源，可以解碼魚類對環(huán)境變化(包括氣候變化)的反應(yīng)。
        

        尋找海底總動員的基因
        

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        在由阿卜杜拉國王科技大學(xué)(KAUST)和ARC珊瑚礁研究卓越中心(Coral CoE)領(lǐng)導(dǎo)的突破性研究中，研究人員使用高科技測序工具為其創(chuàng)建了一個(gè)最完整的遺傳圖譜。橙色小丑魚，一個(gè)普通的礁石居民和迪斯尼電影的明星，海底總動員。
        

        “該基因組提供了理解珊瑚魚生物學(xué)各個(gè)方面的基本藍(lán)圖，”主要作者，沙特阿拉伯KAUST的Robert Lehmann博士說。
        

        “它包含26,597個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因。就像世界上最大的拼圖游戲一樣，需要耐心和時(shí)間來組裝。”
        

        橙色小丑魚Amphiprion percula不僅是地球上最受認(rèn)可的珊瑚魚，也是研究最多的魚類之一。
        

        “該物種對珊瑚魚的生態(tài)，環(huán)境和進(jìn)化方面的突破性研究至關(guān)重要，”共同作者，澳大利亞詹姆斯庫克大學(xué)Coral CoE教授Philip Munday說。
        

        “例如，小丑魚是研究魚類性別變化的模型。它還幫助我們了解珊瑚魚中幼蟲傳播的模式，它是第一個(gè)被證明可以通過海洋酸化損害捕食者避免行為的魚類。 “。
        

        該團(tuán)隊(duì)使用最先進(jìn)的技術(shù)對小丑魚的基因組進(jìn)行測序。他們的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)現(xiàn)在可通過http://nemogenome.org上的Nemo Genome DB數(shù)據(jù)庫獲得。
        

        “小丑魚需要大約9.39億個(gè)核苷酸需要配合在一起，”KAUST的共同作者Timothy Ravasi教授說。
        

        “這對于研究界來說是非常寶貴的資源，并將進(jìn)一步建立橙色小丑魚作為遺傳學(xué)和基因組研究的理想實(shí)驗(yàn)室主題。”
        

        “這是有史以來最完整的魚類基因組之一，”詹姆斯庫克大學(xué)Coral CoE的共同作者David Miller教授說。
        

        “使用PacBio單分子，實(shí)時(shí)測序技術(shù)，使我們能夠獲得優(yōu)異的結(jié)果。”
        

        文章“尋找海底總動員的基因：組織小丑魚基因組的染色體尺度參考組裝，Amhiprion percula”今天發(fā)表在分子生態(tài)學(xué)資源雜志上。
        
			

			
          
        
			
        
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