综合精品天天夜夜久久,日本中文字幕二区区精品,亚洲欧美中文字幕制服二区,青青青国产爽爽视频免费观看

        中國基因網(wǎng)您的位置:首頁 >企業(yè)新聞 >

        研究人員發(fā)現(xiàn)RNA-seq技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)經(jīng)常存在技術(shù)偏差

        研究數(shù)據(jù)的可重現(xiàn)性是實驗生物學(xué)面臨的一大挑戰(zhàn)..隨著基因組規(guī)模技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)的復(fù)雜性增加,這一關(guān)切變得越來越令人擔(dān)憂。

        RNA-seq是現(xiàn)代分子生物學(xué)中應(yīng)用最廣泛的方法之一,它允許在一次測試中同時測量給定樣品中所有基因的表達水平。特拉維夫大學(xué)一個小組的新研究發(fā)現(xiàn),RNA-seq技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)中經(jīng)常存在技術(shù)偏差,這往往導(dǎo)致錯誤的結(jié)果。

        這項研究由Shir Mandelbaum博士、Zohar Manber博士、Orna Erroy-Stein博士和Dr進行。在TAU的Sackler醫(yī)學(xué)院和George S.Wise生命科學(xué)學(xué)院的Ran Elkon,并于11月12日在PLOS生物學(xué)上發(fā)表。

        近幾年來,人們對生物學(xué)研究中的錯誤結(jié)果越來越感到震驚,有時被稱為重復(fù)性危機。這項研究強調(diào)對數(shù)據(jù)進行適當(dāng)?shù)慕y(tǒng)計處理的重要性,以減少誤導(dǎo)性調(diào)查結(jié)果的數(shù)量。

        博士該研究的主要作者Ran Elkon

        RNA-seq實驗的一個主要目標(biāo)是描述在不同條件下被激活或抑制的生物過程。研究人員分析了幾十個公開的RNA-seq數(shù)據(jù)集,以分析細胞對許多壓力的反應(yīng)。

        在這項研究中,科學(xué)家們注意到,一組特別短或長的基因反復(fù)顯示了由給定基因的RNA轉(zhuǎn)錄本的明顯數(shù)量所測量的表達水平的變化。研究小組對這種反復(fù)出現(xiàn)的模式感到困惑,想知道它是否反映了不同觸發(fā)因素共同的一些普遍的生物反應(yīng),或者它是否源于某種實驗條件。

        為了解決這個問題,他們比較了來自相同生物學(xué)條件的復(fù)制樣本。復(fù)制間基因表達的差異可以反映出與實驗興趣的生物因素?zé)o關(guān)的技術(shù)效應(yīng)。出乎意料的是,在復(fù)制之間的這些比較中觀察到了顯示表達水平變化的特別短或長基因的相同模式。研究人員說,這種模式是一種技術(shù)偏見的結(jié)果,這種偏見似乎與基因長度有關(guān)。

        重要的是,TAU研究人員能夠展示他們在許多RNA-seq數(shù)據(jù)集中檢測到的長度偏差如何導(dǎo)致對特定生物功能的錯誤識別,作為對所測試條件的細胞反應(yīng)..

        埃爾肯博士總結(jié)說:“這種對數(shù)據(jù)的誤解可能導(dǎo)致完全誤導(dǎo)的結(jié)論?!睂嶋H上,這項研究還顯示了如何從數(shù)據(jù)中消除這種偏見,從而過濾掉錯誤的結(jié)果,同時保留與生物相關(guān)的結(jié)果。


        鄭重聲明:本文版權(quán)歸原作者所有,轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的,如有侵權(quán)行為,請第一時間聯(lián)系我們修改或刪除,多謝。

        推薦內(nèi)容