研究人員對莫哈韋沙漠烏龜?shù)男蛄谢蚪M

亞利桑那州立大學領導的一組科學家對莫哈韋沙漠烏龜(Gopherus agassizii)的基因組進行了測序，該物種是莫哈韋沙漠的一種長壽物種。結(jié)果可以幫助動物生存越來越多的威脅。

莫哈韋沙漠烏龜是大約三千五百萬年前在北美出現(xiàn)的六種沙漠烏龜之一，可以在加利福尼亞，內(nèi)華達州，猶他州和亞利桑那州找到。

也被稱為阿加西(Agassiz)的沙漠龜，該物種已受到棲息地喪失，呼吸道疾病和其他人為因素的嚴重影響。例如，在該物種的一個區(qū)域中，密度范圍從1979年的225個人/ km 2下降到1992年的約75個人/ km 2。

莫哈韋沙漠烏龜在美國《瀕危物種法》中被列為“受威脅”，并被國際自然保護聯(lián)盟(IUCN)視為“易受傷害”。

為了幫助保護該物種遺傳多樣性的保護工作，亞利桑那州立大學教授Kenro Kusumi和他的合著者生成了一個全基因組參考序列，并帶有基于成人骨骼肌，肺，腦和血液的深轉(zhuǎn)錄組序列的注釋。

亞利桑那州立大學的合著者馬克·托利斯博士說：“莫哈韋沙漠烏龜基因組是保護該物種的重要資源，特別是因為該種群正遭受嚴重疾病的困擾。”

“研究人員尚未完全了解其原因或使烏龜易感的原因。”

“對該基因組進行解碼將有助于我們對哪些烏龜基因進行足夠迅速的進化以幫助它們克服這一威脅進行分類。”

研究人員獲得了特定烏龜標本的遺傳數(shù)據(jù)，組裝并注釋了基因組，并了解了烏龜?shù)倪M化史。

Kusumi教授說：“從技術上來說，對基因組進行解碼變得容易得多。”

“目前的挑戰(zhàn)是對烏龜基因組中的信息進行解碼。我們可以利用與小鼠和人類基因組相似性的線索。”

“找到廣為人知的'大海撈針'將是確定指導針對傳染病的免疫反應的基因，以及在莫哈韋沙漠惡劣條件下生存的能力。”

他補充說：“對我們來說，了解烏龜多樣性在其地理范圍內(nèi)的位置非常重要。”

“確定遺傳多樣性的熱點有助于從保護的角度管理物種，并保護烏龜種群，以便在未來幾年更好地應對未知的挑戰(zhàn)。”

研究小組還分析了莫哈韋沙漠烏龜與其姐妹物種索諾蘭沙漠烏龜(Gopherus morafkai)的遺傳差異。

“我希望這項研究將使其他機構(gòu)能夠提出新的問題，如果沒有這項研究他們將無法提出這些問題，”合著者，亞利桑那州立大學的Greer Dolby博士說。

“例如，'烏龜必須與哪些免疫基因?qū)共≡w?他們的免疫系統(tǒng)如何在面臨許多威脅的環(huán)境中發(fā)揮作用?而且，不斷變化的環(huán)境將如何影響這一點?” 這些是管理物種時要回答的重要問題?，F(xiàn)在，我們可以開始調(diào)查了。”

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