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        研究人員發(fā)表了微生物譜 以支持腸道研究領(lǐng)域的發(fā)展
        
			
        
				2019-09-14 18:05:44
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        根據(jù)喬治華盛頓大學(xué)(GW)研究人員在PLOS ONE期刊上發(fā)表的研究，有157種生物形成了健康人體腸道的基線生物群落。如果考慮密切相關(guān)的蛋白質(zhì)組，基線微生物譜，稱為GutFeelingKB，可以擴展到863種生物。這些信息將作為醫(yī)生，患者和研究人員的參考清單，讓他們了解“正常”人類微生物組的樣子。
        

        我們越了解人類微生物組，就越了解它對我們健康的重要性。了解健康的人體腸道是什么樣的，對于研究如何診斷，治療和預(yù)防微生物群問題至關(guān)重要。“
        

        研究人員發(fā)表了微生物譜 以支持腸道研究領(lǐng)域的發(fā)展
        

        Raja Mazumder博士，GW醫(yī)學(xué)與健康科學(xué)學(xué)院的生物化學(xué)與分子醫(yī)學(xué)共同作者和教授
        

        在進行任何類型的臨床前或臨床研究之前，必須全面了解居住在健康人體腸道中的微生物的類型和比例。對于希望找到改變微生物組，治療疾病或改善治療結(jié)果的方法的研究人員來說，這也很重要。GutFeelingKB可以作為研究人類微生物組的健康控制。
        

        為了編制他們的數(shù)據(jù)庫，該研究小組對來自華盛頓特區(qū)招募的16名健康參與者的48份糞便樣本進行了遺傳測序，此外還使用了從人類微生物組項目下載的50個糞便宏基因組樣本，這些樣本也被篩選為健康人。在GutFeelingKB中描述的157種生物中，20%是梭菌屬，19%是Bacterioidia，17%是雙歧桿菌，14%是腸桿菌，并且來自Firmicutes門，20%是梭菌，14%是乳桿菌 - 在益生菌中發(fā)現(xiàn)的所有類別的細菌酸奶等食物。研究小組指出，所有樣本中共有84種生物，這表明這組細菌可能是人類腸道的核心物種。
        

        該研究得到了國家科學(xué)基金會的資助，國家推進轉(zhuǎn)化科學(xué)中心的臨床和轉(zhuǎn)化科學(xué)獎項目，McCormick基因組和蛋白質(zhì)組學(xué)中心以及GW和兒童國家的臨床轉(zhuǎn)化科學(xué)研究所(CTSI)的資助。華盛頓特區(qū)原始序列數(shù)據(jù)是在KamTek，Inc。生成的，使用MiSeq Illumina儀器在馬里蘭州羅克維爾的蒙哥馬利學(xué)院進行補貼定價。
        

        “這項研究展示了多學(xué)科團隊科學(xué)推動轉(zhuǎn)化研究的力量，因為該團隊涉及來自GW內(nèi)多個機構(gòu)，學(xué)科和學(xué)校的同事，”CTSI資助的信息學(xué)聯(lián)合負責(zé)人Keith A. Crandall博士說。作者，GW的米爾肯公共衛(wèi)生學(xué)院計算生物學(xué)研究所所長。“GutFeelingKB提供了一個基礎(chǔ)模型和初步數(shù)據(jù)，以開始了解健康腸道微生物組的多樣性，這是任何試圖檢測與微生物組變化相關(guān)的疾病的研究的關(guān)鍵組成部分。”
        

        除了創(chuàng)建GutFeelingKB之外，該研究小組還發(fā)表了一份名為FecalBiome的新型糞便生物群落人口報告，該報告具有臨床應(yīng)用能力。FecalBiome可以幫助醫(yī)生將患者的微生物組與健康個體的微生物組進行比較，使他們能夠更好地評估糞便移植物和其他微生物組產(chǎn)品的有效性。研究團隊還為醫(yī)生開發(fā)了一個原型報告模板，以便將信息傳遞給患者。
        

        “揭示腸道微生物物種與人體宿主之間復(fù)雜的代謝交換對于各種各樣的健康狀況，甚至可能是我們的情緒都有著巨大的影響。微生物組能夠”調(diào)整“以增加有益的細菌種群嗎?我們的飲食如何影響這種調(diào)節(jié)“我們很高興知識庫將讓我們量化這些變化，并將它們與人類健康聯(lián)系起來，”Hiroki Morizo??no博士說，他是CTSI資助的信息學(xué)聯(lián)合負責(zé)人，共同作者，兒童國家和副研究教授的生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)主任GW醫(yī)學(xué)與健康科學(xué)學(xué)院的基因組學(xué)，精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和兒科學(xué)。
        
			

			
          
        
			
        
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