便攜式DNA測序儀幫助非洲農(nóng)民對抗作物病害
西澳大利亞大學(xué)的科學(xué)家們首次在東非使用新的便攜式DNA測序技術(shù),幫助農(nóng)民抗擊作物病害的破壞性影響。使用便攜式實(shí)時(shí)DNA分析設(shè)備,與病害木薯作物作斗爭的農(nóng)民可以根據(jù)有關(guān)植物健康的信息立即采取措施挽救他們的生計(jì)。
DNA手持式測序儀,名為MinION,由英國公司Oxford Nanopore開發(fā)。它被用來確定哪種病毒株正在摧毀坦桑尼亞和烏干達(dá)農(nóng)民的木薯作物,這是科學(xué)家和農(nóng)民合作的一部分,稱為木薯病毒行動計(jì)劃(CVAP)。
西澳大學(xué)高級研究員Laura Boykin博士是該項(xiàng)目的主要研究人員之一,坦桑尼亞Mikocheni農(nóng)業(yè)研究??所所長Joseph Ndunguru和烏干達(dá)國家農(nóng)業(yè)研究組織研究項(xiàng)目負(fù)責(zé)人Titus Alicai。
Boykin博士說,因?yàn)镸inION能夠?qū)崟r(shí)提供信息,與通常的三個(gè)月相比,農(nóng)民能夠更快地采取行動。
全球有8億人依賴受威脅的木薯作物,該團(tuán)隊(duì)現(xiàn)在計(jì)劃擴(kuò)大該項(xiàng)目,旨在降低社區(qū)作物歉收的風(fēng)險(xiǎn)并幫助維持生計(jì)。
木薯是木薯來源的碳水化合物作物,在發(fā)展中國家的農(nóng)業(yè)中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。它目前被幾種導(dǎo)致兩種疾病的病毒所摧毀;“木薯花葉病”(CMD)導(dǎo)致了20世紀(jì)20年代和90年代的大饑荒,以及“木薯棕色條紋病”(CBSD),其流行病在東非迅速擴(kuò)散。
由粉虱攜帶的這兩種疾病都阻止了木薯植物的正常生長。這導(dǎo)致農(nóng)民的收成顯著減少甚至完全損失。病毒使植物不能食用和不可銷售,必須銷毀作物以阻止其蔓延。
Ndunguru先生說:“我們已經(jīng)證明口袋DNA測序儀可以使那些通常無法獲得此類技術(shù)的農(nóng)村社區(qū)受益,因?yàn)樗鼈兺ǔ8嘿F,更慢。”
“即使在這個(gè)試點(diǎn)項(xiàng)目中,通過快速準(zhǔn)確地識別病毒,農(nóng)民現(xiàn)在可以了解哪些作物可以種植,這些作物對特定的病毒種類/菌株具有抗性。這是獲得持久抗病性和提高作物生產(chǎn)力的關(guān)鍵。它也易于使用,無需大型基礎(chǔ)設(shè)施和人員配備。
Boykin博士說,該團(tuán)隊(duì)計(jì)劃在坦桑尼亞和烏干達(dá)擴(kuò)大該項(xiàng)目,并與尚未受到木薯粉虱病毒影響的其他國家合作,如泰國和巴西。
“如果沒有找到更好的策略來應(yīng)對這種作物病害,那么數(shù)百萬人可能會受到影響 - 我們需要考慮經(jīng)濟(jì)以及個(gè)體家庭,”她說。
MinION重量僅為100克,可用于任何可以插入筆記本電腦或PC的地方,用于對木薯植物和粉虱進(jìn)行測序,從而確定存在的病毒的精確菌株以及品種農(nóng)民種植的木薯
木薯疾病診斷項(xiàng)目由比爾和梅林達(dá)蓋茨基金會和英國國際發(fā)展部共同資助。
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