新的“電影”技術以更清晰的分辨率顯示細菌信號

在新研究之后，細菌用于適應環(huán)境的復雜信號網絡變得更加清晰。約翰英納斯中心的研究人員利用對植物生長促進細菌熒光假單胞菌的研究開發(fā)了一種先進的分析方法，他們希望這種方法能夠提高我們了解植物和人類疾病的能力。

直到最近，對細菌信號傳導的研究傾向于孤立地研究基因調控的不同方面。在這些個體方法的基礎上，John Innes團隊使用一系列實驗室，計算和數學技術來整合從多個不同微生物實驗中獲得的數據。

這種方法使他們能夠為關鍵的細菌蛋白Hfq建立一個全面的“信號圖”，該蛋白可以控制許多臨床和農業(yè)上重要的物種的毒力和應激反應。

與該項工作相關的項目負責人Jacob Malone博士解釋說：“我們的技術使我們能夠跟蹤細菌細胞中的每個基因和蛋白質，并根據給定的信號輸入說明它如何變化以及變化發(fā)生的程度。

“我們使用與之前研究相同的數據集，但我們開發(fā)了一種使用數學和編程整合數據的方法。如果你考慮電影的各個元素：攝影，配樂和劇本;通過組合它們你得到整部電影 - 比部分之和更大的東西。這是相同的原則，只有遺傳。“

該團隊的研究結果發(fā)表在微生物學前沿(分析Hfq的復雜監(jiān)管環(huán)境 - 綜合，多組學方法，Grenga，L。等人2017)，有望改變我們調查細菌信號網絡的方式，并將推進我們的研究了解細菌如何與環(huán)境相互作用并調節(jié)感染。

“人們之前已經在多個層面上查看了數據，但并未達到這一深度。”馬龍博士說。“最終，我們希望人們考慮以這種方式定期處理數據，”。

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