人類細(xì)胞地圖集(HCA)聯(lián)盟發(fā)布了國(guó)際計(jì)劃努力創(chuàng)建所有人體細(xì)胞綜合參考圖的藍(lán)圖，該項(xiàng)目將成為更深入了解人類健康以及診斷，監(jiān)測(cè)和治療的基礎(chǔ)。疾病。藍(lán)圖的發(fā)布 - 作為白皮書發(fā)布到HCA網(wǎng)站 - 恰逢HCA組織委員會(huì)發(fā)表了一篇自然評(píng)論，總結(jié)了該聯(lián)盟的愿景和使命。

此外，該聯(lián)盟今天還宣布即將從HCA收集的第一百萬個(gè)免疫細(xì)胞中釋放基因表達(dá)譜，最初的里程碑是收集代表幾個(gè)組織和器官的至少3000萬個(gè)細(xì)胞用于地圖集的初稿。這些數(shù)據(jù)將于11月初發(fā)布在在線資料庫中，供研究人員免費(fèi)使用。

藍(lán)圖和數(shù)據(jù)發(fā)布在由以色列雷霍沃特的魏茨曼科學(xué)研究所主辦的第二屆HCA大會(huì)上發(fā)布。會(huì)議慶祝財(cái)團(tuán)成立一周年，標(biāo)志著其從規(guī)劃到運(yùn)營(yíng)階段的正式過渡。

“在過去的一年里，國(guó)際科學(xué)界，從醫(yī)生到計(jì)算機(jī)科學(xué)家，已經(jīng)參與了一個(gè)開放的過程來計(jì)劃如何制作這個(gè)革命性的地圖集，”Aviv Regev說，他是核心成員，教職員和主任。麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)布拉德曼細(xì)胞觀察站和細(xì)胞電路計(jì)劃;一名HHMI調(diào)查員;麻省理工學(xué)院生物學(xué)教授;與HCA組委會(huì)的Wellcome Trust Sanger Institute的Sarah Teichmann共同主持。“我們一起畫了藍(lán)圖。現(xiàn)在是時(shí)候開始建房了。”

“完成時(shí)將為地圖集收集的數(shù)據(jù)將為更深入研究細(xì)胞功能和相互作用提供切入點(diǎn)，無論是在其家庭組織內(nèi)還是更廣泛地在整個(gè)身體內(nèi)，”細(xì)胞遺傳學(xué)負(fù)責(zé)人Teichmann說。桑格研究所，劍橋大學(xué)物理系研究主任，劍橋丘吉爾學(xué)院高級(jí)研究員。“隨著時(shí)間的推移，這些知識(shí)將對(duì)人類生物學(xué)和人類健康的科學(xué)理解產(chǎn)生變革性影響。”

全球戰(zhàn)略藍(lán)圖

HCA于2016年啟動(dòng)，目標(biāo)是人類基因組計(jì)劃的范圍雄心勃勃：創(chuàng)建所有人體細(xì)胞的參考目錄，其比例，位置以及它們之間的相互作用。白皮書指出，對(duì)于地圖集的初稿，該聯(lián)盟將使用大規(guī)模平行的單細(xì)胞RNA測(cè)序(一套能夠鑒定基因的基因組技術(shù))研究和繪制來自選定器官和組織的3億至1億個(gè)細(xì)胞。一次成千上萬個(gè)細(xì)胞中的表達(dá)譜，用于表征其他分子的相關(guān)技術(shù)，以及用于繪制細(xì)胞位置和相互作用的空間方法。

該聯(lián)盟的長(zhǎng)期目標(biāo)是分析至少100億個(gè)細(xì)胞，覆蓋所有組織，器官和系統(tǒng)，代表健康組織以及受特定疾病和病癥影響的組織。完整的地圖集將盡可能多樣化，捕捉一系列疾病，地理位置，環(huán)境和年齡組。

治理

除了確定地圖集初稿的目標(biāo)和范圍外，白皮書還概述了財(cái)團(tuán)的組織和治理結(jié)構(gòu)，重點(diǎn)強(qiáng)調(diào)科學(xué)多樣性和包容性。它還提供了一套以道德，公平和開放為基礎(chǔ)的指導(dǎo)原則，反映了財(cái)團(tuán)的科學(xué)基層起源。

HCA由HCA的決策機(jī)構(gòu)組委會(huì)(OC)指導(dǎo)和管理。該OC由來自10個(gè)國(guó)家的27名科學(xué)家組成，目前由Aviv Regev(Broad Institute)和Sarah Teichmann(Wellcome Trust Sanger Institute)共同擔(dān)任主席。在此處查看HCA領(lǐng)導(dǎo)的完整列表。

“HCA是由科學(xué)家構(gòu)思和發(fā)起的，它由來自10個(gè)國(guó)家的19個(gè)機(jī)構(gòu)的科學(xué)家管理和管理，”日本RIKEN(物理和化學(xué)研究所)基因組技術(shù)部門主任Piero Carninci說。和RIKEN生命科學(xué)技術(shù)中心副主任。“來自世界各地的數(shù)十位科學(xué)家，包括亞洲各國(guó)，已經(jīng)表達(dá)了他們對(duì)參與HCA研究并為其提供專業(yè)知識(shí)的興趣。”

數(shù)據(jù)來自第一百萬個(gè)細(xì)胞，并且路徑達(dá)到了一百億個(gè)

今天宣布的免疫細(xì)胞表達(dá)數(shù)據(jù)將于11月初在公共在線資源中提供，包括從骨髓和健康人類供體的臍帶血收集的大約一百萬個(gè)細(xì)胞的單細(xì)胞RNA表達(dá)譜。

該表達(dá)數(shù)據(jù)將免費(fèi)提供，允許科學(xué)界成員在研究中使用該信息。對(duì)開放獲取的承諾是HCA的核心價(jià)值之一，以及關(guān)鍵的道德考慮因素。

人類細(xì)胞圖譜(HCA)是一個(gè)國(guó)際合作聯(lián)盟，旨在創(chuàng)建所有人類細(xì)胞的全面參考圖- 生命的基本單位 - 作為理解人類健康和診斷，監(jiān)測(cè)和治療疾病的基礎(chǔ)。HCA是一種基礎(chǔ)的，開放的資源，用于繪制全身的細(xì)胞，組織，器官和系統(tǒng)。HCA將影響生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的各個(gè)方面，推動(dòng)翻譯發(fā)現(xiàn)和應(yīng)用，并最終開創(chuàng)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的新時(shí)代。