利用eDNA鑒定瀕危物種的繁殖棲息地
日本研究人員利用廣泛的eDNA分析結(jié)合傳統(tǒng)的采集調(diào)查方法,確定了日本秋田縣奧莫諾河主流瀕危魚(yú)類(lèi)Acheilognathus typus的繁殖地。該研究結(jié)果發(fā)表于11月14日的在線版“自然科學(xué)-Naturwissenschaften”。
調(diào)查水生生物是一個(gè)漫長(zhǎng)而費(fèi)力的過(guò)程,覆蓋面廣,也需要很高的成本。環(huán)境DNA(eDNA)分析為這些問(wèn)題提供了解決方案。在湖泊,水庫(kù)和河流等水下環(huán)境中,我們可以發(fā)現(xiàn)水中的DNA碎片從糞便,皮膚或任何其他水棲生物來(lái)源漂流。eDNA的分析對(duì)諸如A. typus等稀有物種特別有效,由于人口密度低,難以通過(guò)傳統(tǒng)的調(diào)查方法找到。在這項(xiàng)研究中,研究小組進(jìn)行了廣泛的eDNA調(diào)查,隨后進(jìn)行了傳統(tǒng)的收集調(diào)查,以尋找日本秋田縣Omono河的A. typus的新繁殖棲息地。
在2016年8月的三天中,該團(tuán)隊(duì)從99個(gè)地點(diǎn)收集了地表水樣本,覆蓋了112公里的Omono河,并從樣本中提取了eDNA。他們使用針對(duì)A. typus的特定檢測(cè)系統(tǒng)測(cè)量DNA。在此之后,他們?cè)跈z測(cè)到eDNA的地方放置了固定的網(wǎng)和瓶子陷阱,并確認(rèn)了成魚(yú)的存在。該團(tuán)隊(duì)還使用雙殼類(lèi)動(dòng)物(其中A. typus產(chǎn)卵)確認(rèn)它們正在繁殖。
在接受調(diào)查的Omono河的99個(gè)地點(diǎn),在2個(gè)地方發(fā)現(xiàn)了A. typus eDNA,在其中一個(gè)地點(diǎn),該團(tuán)??隊(duì)捕獲了一個(gè)男性和一個(gè)女性標(biāo)本。在同一個(gè)地方的雙殼類(lèi)中發(fā)現(xiàn)了卵,因此它們成功地將其鑒定為A. typus繁殖地。
這些研究結(jié)果表明,在成本和可靠性方面,eDNA分析和傳統(tǒng)收集方法的結(jié)合在識(shí)別稀有物種的棲息地和繁殖區(qū)方面非常有效。這些方法相互補(bǔ)充:eDNA方法適用于廣泛區(qū)域的測(cè)量,而樣品采集對(duì)于確認(rèn)物種非常可靠。這種方法的組合可以通過(guò)尋找更多的繁殖區(qū)域和建立保護(hù)區(qū)來(lái)幫助保護(hù)這一物種。它也可以用于其他稀有和瀕危物種,人口密度低,分布廣泛。
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