DropSynth,基因合成的一鍋法
加利福尼亞大學(xué)的一組研究人員發(fā)現(xiàn)了一種從一組微陣列生成的寡核苷酸合成多個(gè)基因的方法。在他們發(fā)表在“科學(xué)”雜志上的論文中,該小組描述了他們的技術(shù),稱為DropSynth,它的工作原理及其缺點(diǎn)。
合成基因已經(jīng)變得如此受歡迎,以至于現(xiàn)在有公司以它為生,但它仍然是一個(gè)昂貴的命題 - 目前的方法需要在它們被創(chuàng)建之后一次一個(gè)地縫制小鏈。在這項(xiàng)新的研究中,研究人員報(bào)告了基因合成的一鍋法,可以降低成本。
目前,使用微陣列進(jìn)行基因合成,產(chǎn)生DNA寡核苷酸,然后必須縫合在一起 - UoC的團(tuán)隊(duì)也開(kāi)始使用微陣列,但他們首先給予寡核苷酸一個(gè)識(shí)別長(zhǎng)度的基因序列,他們形容為“條形碼”。接下來(lái),他們添加了具有互補(bǔ)條形碼的微珠,其可以從不同種類的寡核苷酸庫(kù)中提取匹配的寡核苷酸。結(jié)果是微珠池,每個(gè)微珠具有一小組附著的相同類型的寡核苷酸。然后,研究小組將每個(gè)微珠(及其寡核苷酸組)用乳液液滴封閉,使用他們所描述的寡核苷酸和油混合物渦旋30秒。之后,酶在單個(gè)液滴中誘導(dǎo)所有寡核苷酸合并(通過(guò)聚合酶循環(huán)組裝),產(chǎn)生所需序列。然后從乳液中取出序列以備使用。
該團(tuán)隊(duì)表示,該過(guò)程優(yōu)于傳統(tǒng)方法,因?yàn)樗耘c寡核苷酸池基本相同的成本提供對(duì)基因庫(kù)的訪問(wèn)- 它不會(huì)增加太多。不幸的是,有一個(gè)很大的缺點(diǎn)。他們指出,這個(gè)過(guò)程是“混亂的”,因?yàn)樗挥写蠹s5%的效率 - 不足以用于制造過(guò)程。從更積極的方面來(lái)說(shuō),該方法可以用于創(chuàng)建大型基因庫(kù),用于各種目的,成本非常低。它也可用于研究工作,特別是那些涉及蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)的研究工作。
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