尋找與行為相關(guān)的基因的新指南
有興趣尋找影響人類(lèi)和動(dòng)物行為的特定基因的科學(xué)家們有了一個(gè)新的工具,這要?dú)w功于為期兩年的研究工作,旨在描述如何將最新的分子基因組學(xué)技術(shù)應(yīng)用于復(fù)雜行為的研究。
“當(dāng)你進(jìn)入基因組學(xué)時(shí),學(xué)習(xí)曲線非常陡峭,如果你從一個(gè)知識(shí)匱乏的地方開(kāi)始,那將是非常令人生畏的,”萊斯大學(xué)行為生態(tài)學(xué)家薩拉·本斯頓說(shuō),他是一篇新評(píng)論文章的主要作者。行為科學(xué)家的基因組工具。
“我是需要這篇論文的人,”本斯頓說(shuō),他是賴斯生物科學(xué)系生理學(xué)和進(jìn)化生物學(xué)的赫胥黎教授研究員。“我需要一個(gè)新手級(jí)的介紹,如何基因組工具可以幫助我回答研究問(wèn)題。例如,我的實(shí)驗(yàn)設(shè)置是一個(gè)適用于基因組測(cè)序或任何分子技術(shù)的系統(tǒng)嗎?我找不到那種參考所以我和一群非常聰明的人一起寫(xiě)了一篇。“
這篇文章本周出現(xiàn)在“自然生態(tài)學(xué)與進(jìn)化論”(Nature Ecology and Evolution)中,旨在指導(dǎo)任何學(xué)科的行為科學(xué)家,提出關(guān)于基因組學(xué)工具是否適合他們研究的具體建議,如果是這樣,哪些工具可能最適合他們的實(shí)驗(yàn)室工作。
Bengston說(shuō)她在2015年完成研究生學(xué)習(xí)后不久就開(kāi)始努力學(xué)習(xí)如何將基因組學(xué)研究納入自己的研究項(xiàng)目。她曾在羅切斯特大學(xué)獲得國(guó)家科學(xué)基金會(huì)(NSF)博士后獎(jiǎng)學(xué)金,并試圖建立自己的研究項(xiàng)目。
“行為連接了很多領(lǐng)域,”她說(shuō)。“如果你是一位進(jìn)化生物學(xué)家,生態(tài)學(xué)家,神經(jīng)生物學(xué)家或心理學(xué)家,那么行為變異對(duì)你來(lái)說(shuō)本身就很有趣。例如,為什么有些人比其他人更具攻擊性?為什么我們經(jīng)常會(huì)看到更高層次的攻擊性還有更多的探索性?我們已經(jīng)研究過(guò)這些問(wèn)題多年了,我們知道其中很多都是遺傳特征,但我們傾向于止步于此。“
Bengston在伊利諾伊大學(xué)厄本那 - 香檳分校聽(tīng)說(shuō)了NSF關(guān)于基因組學(xué)和行為生態(tài)學(xué)的研討會(huì)。
“我已經(jīng)基本知道什么對(duì)我不起作用,因?yàn)槲乙呀?jīng)嘗試了很多次而且失敗了,”她說(shuō)。“我走進(jìn)那個(gè)研討會(huì),希望有人能指出我這篇新手級(jí)的入門(mén)書(shū)。”
相反,她在行為和基因組學(xué)方面找到了一個(gè)充滿志同道合的專家的房間,他們致力于運(yùn)用他們的專業(yè)知識(shí)來(lái)理解行為變異。該小組決定系統(tǒng)地解決這個(gè)問(wèn)題。
“我們深入研究基因組學(xué)領(lǐng)域,將可用工具分解為類(lèi)別,并將這些工具與一些反復(fù)出現(xiàn)的重大行為問(wèn)題配對(duì),”Bengston說(shuō)。“我們產(chǎn)生了大約30個(gè)關(guān)于如何應(yīng)用這些工具的假設(shè),然后我們提出了使用可用工具解決這些假設(shè)的方法。”
該小組還發(fā)現(xiàn),行為主義者需要更加積極地注釋基因組以及與注釋基因組的非行為主義者合作。
“沒(méi)有行為友好的基因庫(kù),因?yàn)樗皇亲⑨屵@些基因組的行為主義者,”她說(shuō)。“如果行為主義者進(jìn)行轉(zhuǎn)錄測(cè)序并進(jìn)入其中一個(gè)基因庫(kù),并且說(shuō)'我對(duì)所有這些基因進(jìn)行了點(diǎn)擊',那么這個(gè)搜索很容易回歸到一個(gè)與細(xì)胞有關(guān)的幾十個(gè)基因的列表中。像膜轉(zhuǎn)移的功能。
“這可能是因?yàn)樽⑨尰蚪M的人只關(guān)注細(xì)胞功能。沒(méi)有任何東西可以幫助行為主義者理解,'好吧,這可能是一種細(xì)胞功能基因,但它也對(duì)行為產(chǎn)生重大影響。'”
Bengston說(shuō),對(duì)行為生態(tài)學(xué)家的基因組工具的審查已經(jīng)在她自己的實(shí)驗(yàn)室中獲得了回報(bào)。
“我正在使用它作為我自己的向?qū)斑M(jìn),”她說(shuō)。“例如,我已經(jīng)使用了我們的假設(shè)表。當(dāng)我考慮研究問(wèn)題時(shí),將這個(gè)指南放在我面前是非常好的。這里不乏有趣或重要的問(wèn)題,但這有助于我看到我可能有哪些問(wèn)題。有機(jī)會(huì)回答。“
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