科學家們產(chǎn)生了高質(zhì)量的小麥A基因組序列
面包小麥(Triticum aestivum L.)占人口的35%以上,提供人類消耗的卡路里和蛋白質(zhì)的20%左右,是一種全球重要的作物,因為它對各種氣候和改良谷物的適應性增強面包生產(chǎn)的質(zhì)量。由于其復雜的多倍性(六倍體,含有A,B和D三個亞基因組)和大基因組大小(17 Gb),面包小麥的遺傳和功能分析極具挑戰(zhàn)性。
A基因組源自二倍體野生einkorn小麥Triticum urartu,基因組大小約為5 Gb,是面包小麥和其他多倍體小麥的基本基因組。它在小麥進化,馴化和遺傳改良中發(fā)揮著核心作用。為了說明小麥的基因組結(jié)構(gòu),中國科學院的小麥基因組研究小組及其合作者通過結(jié)合BAC-by-BAC測序,單分子,真實,產(chǎn)生了高質(zhì)量的T. urartu基因組序列。 - 時間,全基因組鳥槍測序和下一代繪圖技術。
科學家們制作了7個染色體尺度的假分子,預測了41,507個蛋白質(zhì)編碼基因,并提出了T. urartu染色體的進化模型。然后他們發(fā)現(xiàn),與水稻,高粱和短柄草相比,由于轉(zhuǎn)座因子的廣泛擴增和廣泛的基因丟失,起源于T. urartu的古代基因組重復的共線性被強烈破壞。
與面包小麥的A,B和D亞基因組的比較分析也表明,在小麥進化過程中發(fā)生了四種大的染色體結(jié)構(gòu)變異。人口基因組學分析顯示,來自肥沃新月的T. urartu種質(zhì)形成了三個不同的群體,對高海拔和生物應力具有不同的適應性,例如白粉病。
T. urartu的基因組序列為多倍體小麥基因組的分析提供了二倍體參考,是系統(tǒng)研究小麥和相關草的基因組進化和遺傳變異的寶貴資源。它有望促進發(fā)現(xiàn)賦予小麥遺傳改良重要特征的基因,以應對全球糧食安全和可持續(xù)農(nóng)業(yè)的未來挑戰(zhàn)。
研究結(jié)果在Nature的一篇論文中在線發(fā)表,標題為“小麥A亞基因組Triticum urartu祖先的基因組序列”。
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