科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了控制細(xì)菌工廠生物技術(shù)目標(biāo)的新方法
Cheryl Kerfeld的實(shí)驗(yàn)室宣布在操縱微生物工廠方面取得突破,這些工廠在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn),在生物技術(shù)領(lǐng)域具有很大的前景。
這些名為expand iconbacterial microccompartments的工廠在本質(zhì)上很普遍,根據(jù)主機(jī)的不同而做不同的事情。例如,在擴(kuò)大從太陽(yáng)獲取能量的藍(lán)藻中,它們有助于構(gòu)建高能化合物。在我們自己的膽量中,致病細(xì)菌使用工廠 - 因?yàn)樗鼈兯M(jìn)行的過(guò)程在它們之外效率低下,有時(shí)使用有毒物質(zhì) - 超過(guò)我們的“好”細(xì)菌。
科學(xué)家們希望用新機(jī)器改造工廠以執(zhí)行設(shè)計(jì)功能。合成版本可持續(xù)生產(chǎn)生物燃料,工業(yè)材料和納米級(jí)醫(yī)療設(shè)備。
但工廠很難合作。
“目前的技術(shù)需要很多天來(lái)準(zhǔn)備和提取合成工廠外殼,”Kerfeld實(shí)驗(yàn)室的博士后Andrew Hagen說(shuō)。“我們?cè)谄渲胁迦攵ㄖ茩C(jī)器的選擇也很有限。我想開(kāi)發(fā)更好的方法來(lái)做這兩件事。”
在新的Nature Communications出版物中,MSU-DOE植物研究實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)宣布了操縱工廠的新方法:
基于互補(bǔ)的親和純化(CAP):可快速篩選工廠的裝配和提取
通過(guò)共價(jià)連接(EnCo)進(jìn)行封裝:這有助于可預(yù)測(cè)地在工廠中插入定制機(jī)器
CAP:像足球一樣拼湊工廠
工廠看起來(lái)像足球。它們的墻壁由膨脹的iconprotein瓷磚制成,形狀像六邊形和五邊形,它們咬合在一起形成一個(gè)外殼。
在實(shí)驗(yàn)室中,科學(xué)家們依靠化學(xué)混合物來(lái)制造合成工廠。挑戰(zhàn)是在混合物完成后有效地從混合物中捕獲它們。
新方法顯示了一種更簡(jiǎn)單的方法來(lái)提取工廠:
該團(tuán)隊(duì)創(chuàng)建了一個(gè)缺少一種墻壁蛋白質(zhì)瓷磚的工廠。想象一下沒(méi)有黑色五邊形部分的足球;
他們?yōu)槿笔У拇纱u添加標(biāo)簽。標(biāo)簽就像一個(gè)識(shí)別家養(yǎng)寵物的微芯片;
他們將瓷磚添加到混合物中,當(dāng)它找到工廠時(shí)它會(huì)卡在原位;
團(tuán)隊(duì)在標(biāo)記的瓷磚的幫助下提取工廠。該團(tuán)隊(duì)使用像Velcro一樣的系統(tǒng)來(lái)吸引該標(biāo)簽。
EnCo:分子超級(jí)膠水
科學(xué)家們還報(bào)告了一種在工廠內(nèi)插入自定義擴(kuò)展圖標(biāo)酶的方法。它依賴于一種叫做SPY的新技術(shù),它就像蛋白質(zhì)超級(jí)膠水一樣。
“系統(tǒng)有兩個(gè)實(shí)體,SpyTag和SpyCatcher,彼此吸引,”安德魯說(shuō)。“我們?cè)诠S墻內(nèi)插入一個(gè)SpyCatcher”停靠站點(diǎn)。然后我們?cè)跈C(jī)器上添加一個(gè)SpyTag。一旦進(jìn)入相同的環(huán)境,SPY系統(tǒng)就會(huì)像膠一樣聚集在一起。“
一旦'粘在'工廠,機(jī)器就無(wú)法脫身。
到目前為止,該團(tuán)隊(duì)已設(shè)法將60份單一酶插入工廠。該團(tuán)隊(duì)的目標(biāo)是增加這個(gè)數(shù)字,因?yàn)橐粋€(gè)工廠最好可以容納200份左右。
安德魯補(bǔ)充道,“我們甚至還添加了兩種不同顏色的蛋白質(zhì)。我們發(fā)現(xiàn)我們可以根據(jù)蛋殼的最終”色調(diào)“編制不同比例的每種蛋白質(zhì)。這對(duì)于需要多個(gè)生產(chǎn)步驟的工廠來(lái)說(shuō)非常重要。”
未來(lái)發(fā)展方向
這兩種新方法很好地協(xié)同工作。該團(tuán)隊(duì)制作了一個(gè)工廠外殼,插入機(jī)器,將其密封,并在實(shí)驗(yàn)中提取。
接下來(lái)是實(shí)現(xiàn)一些技術(shù)的承諾。
一種應(yīng)用是生產(chǎn)工業(yè)中使用的化學(xué)品。另一位Kerfeld實(shí)驗(yàn)室科學(xué)家正致力于生產(chǎn)轉(zhuǎn)化為橡膠的分子,這一過(guò)程通常需要化石燃料。該團(tuán)隊(duì)還在考慮醫(yī)療應(yīng)用,如疫苗,以及對(duì)環(huán)境友好的能源材料。
“我們認(rèn)為其他科學(xué)家可以將這些方法用于不同的細(xì)菌及其工廠,”安德魯說(shuō)。“他們很有可能會(huì)廣泛采用它們。”
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