遺傳研究人員對(duì)虹鱒魚的基因組進(jìn)行序列分析
由法國(guó)國(guó)家農(nóng)業(yè)研究所的Yann Guiguen博士領(lǐng)導(dǎo)的科學(xué)家成功測(cè)序了虹鱒魚Oncorhynchus mykiss的基因組。
虹鱒魚是一種細(xì)長(zhǎng)的魚,兩側(cè)從背鰭下面的綠色褪色到黃色和白色,屬于鮭科魚類,也包括鮭魚,炭火和河鱒。
這條魚跨越了大自然和養(yǎng)育的世界,在各種溫度和水質(zhì)條件下自然繁榮,同時(shí)對(duì)馴化做出了很好的反應(yīng),以至于人類從太平洋沿岸傳播到六大洲的水域中茁壯成長(zhǎng)。
在他們的研究中,Guiguen博士及其同事關(guān)注的是自1億年前虹鱒魚發(fā)生罕見(jiàn)的基因組倍增事件以來(lái)基因進(jìn)化的速度。
與涉及突變和有利特征選擇的大多數(shù)進(jìn)化過(guò)程不同,加倍事件的作用類似于可以編輯和重鑄的一段文字的復(fù)制草稿,而沒(méi)有破壞早期版本的風(fēng)險(xiǎn)。
通常情況下,這種倍增事件的后果在科學(xué)中失去了,因?yàn)樗鼈儠?huì)被后代的選擇性力量驅(qū)逐出去。但是,由于1億年是相對(duì)較短的時(shí)間,從進(jìn)化的角度來(lái)說(shuō),鱒魚研究人員實(shí)際上可以瞥見(jiàn)魚的進(jìn)化編輯過(guò)程。
“在人類和大多數(shù)脊椎動(dòng)物中,重復(fù)事件較老,因此仍然存在較少的重復(fù)基因。大多數(shù)重復(fù)基因丟失或修改得太多,以至于隨著時(shí)間的推移它們不再被認(rèn)為是重復(fù)的。在鱒魚和鮭魚中,我們可以看到這個(gè)過(guò)程的早期階段,許多重復(fù)的基因仍然存在,“華盛頓州立大學(xué)的Gary Thorgaard博士說(shuō),該論文的共同作者發(fā)表在Nature Communications雜志上。
該小組利用來(lái)自虹鱒魚的基因組序列和基因表達(dá)數(shù)據(jù)顯示,自其遺傳倍增事件以來(lái),大約一半的蛋白質(zhì)編碼基因已被刪除。
它保留了幾乎所有microRNA基因,有助于調(diào)節(jié)基因表達(dá)。
科學(xué)家們還發(fā)現(xiàn),魚類保留了原始或接近原始的基因,參與了胚胎發(fā)育和神經(jīng)細(xì)胞之間連接的發(fā)展。
與這些變化相關(guān)的時(shí)間表明在諸如此類事件之后的基因進(jìn)化比先前認(rèn)為的要慢得多。
“看來(lái),不同情況下的進(jìn)化速度會(huì)有所不同,”Thorgaard博士說(shuō)。
“有些動(dòng)物,如肺魚和腔棘魚,是'活化石',已經(jīng)存在了數(shù)億年而沒(méi)有太大變化。像北極熊一樣的其他人似乎最近也在進(jìn)化。在鱒魚基因重復(fù)之后,這個(gè)過(guò)程發(fā)生的速度比大多數(shù)其他脊椎動(dòng)物的發(fā)生得慢,我們?nèi)匀豢梢钥吹剿^續(xù)下去。“
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