科學(xué)家對海參基因組進行測序
來自加拿大和中國的一個國際研究小組對經(jīng)濟上重要的Apostichopus japonicus(俗稱日本尖刺海參或日本海參)的基因組進行了測序
海參是Holothuroidea的成員,Holothuroidea是一種棘皮動物(一種也包括海膽和海星的門)。
它們在海鮮和制藥行業(yè)中備受推崇,并且在沒有硬化鈣外骨骼的棘皮動物中具有獨特性,并且具有顯著的再生能力。
為了探索這些特征的遺傳基礎(chǔ),中國研究員Jianhai Xiang博士及其合著者對日本刺參進行了高清基因組測序,覆蓋了其估計的880兆堿基DNA的92%,其中包括30,350個蛋白質(zhì)編碼基因。
“通過比較日本刺參的基因組與其他生物的基因組,我們發(fā)現(xiàn)了大約5.33億年前棘皮動物與半卵形動物分離的證據(jù),海參與大約4.79億年前的其他棘皮動物類分離,”作者說。
“我們發(fā)現(xiàn)雖然海膽基因組包含31個生物礦化基因,但對于形成鈣化骨架至關(guān)重要,但海參只有7個這樣的基因。”
“我們還發(fā)現(xiàn),海參在整個發(fā)育過程中表達了這些生物礦化基因的水平要低得多,可能與海膽相比,它們的身體更柔軟。”
作為一種嚇跑捕食者的策略,海參可以驅(qū)逐他們的內(nèi)臟,然后他們可以在幾周內(nèi)再生。
Xiang博士及其同事發(fā)現(xiàn)了一組重復(fù)的基因 - 稱為PSP94樣基因 - 在海參的再生腸中特異性表達,在其他棘皮動物中沒有相應(yīng)的基因,這表明這些基因可能對動物至關(guān)重要。 '能夠迅速重新生長他們的內(nèi)臟。
第二組稱為纖維蛋白原相關(guān)蛋白的基因也被復(fù)制并在再生過程中高度表達,這表明它們也可能有助于這種能力。
“海參是一種特別有前途的再生醫(yī)學(xué)模型動物,其基因組的可用性應(yīng)有助于研究再生生物學(xué),并確定棘皮動物再生能否提供可用于人類醫(yī)學(xué)的見解,”湘博士說。 ,中國科學(xué)院海洋研究所研究員。
“我們的研究結(jié)果還應(yīng)有助于了解棘皮動物的可持續(xù)利用和有效育種的要求,以支持高價值的海參產(chǎn)業(yè),包括將其用作食品和中藥的來源。”
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