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        改善古生物基因組學(xué)
        
			
        
				2018-12-21 11:04:04
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        脆弱的DNA分子容易受到損害，并且隨著時(shí)間的推移會(huì)被不相關(guān)的DNA污染。DNA序列的標(biāo)準(zhǔn)方法是首先擴(kuò)增微小的DNA樣本。然而，從未經(jīng)過保存的DNA樣品中提取的古老的DNA 1通常難以測(cè)序，因?yàn)樗呀?jīng)屈服于這些侮辱。
        

        改善古生物基因組學(xué)
        

        由丹麥哥本哈根大學(xué)Ludovic Orlando領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)，包括沙特阿拉伯沙特國(guó)王沙特大學(xué)的Khaled Al-Rasheid，報(bào)道了古??老DNA的第一個(gè)真正的單分子測(cè)序。
        

        真正的單分子測(cè)序(tSMS)是一種繞過DNA擴(kuò)增的最先進(jìn)技術(shù)。它允許對(duì)單鏈DNA進(jìn)行測(cè)序，這使得它比標(biāo)準(zhǔn)方法更快。
        

        奧蘭多和他的同事們從永久凍土中保存的馬骨中采集了DNA樣本超過5萬年，并使用tSMS生成了115.9兆堿基。他們?cè)诨蚪M研究中發(fā)表了他們的發(fā)現(xiàn) 。
        

        然后，該團(tuán)隊(duì)采用標(biāo)準(zhǔn)測(cè)序方法從相同樣品中產(chǎn)生76.9兆堿基，并比較兩種技術(shù)產(chǎn)生的序列。
        

        他們證實(shí)標(biāo)準(zhǔn)方法可以從古代DNA中產(chǎn)生可靠的序列，但是用tSMS獲得了更高的序列產(chǎn)量，因?yàn)檫@種方法特別適合于對(duì)極短片段進(jìn)行測(cè)序。
        

        研究人員對(duì)tSMS方案進(jìn)行了簡(jiǎn)單的修改，使馬DNA的比例增加了三倍，從而污染了DNA。
        

        化石骨的某些部分比其他部分含有更多的DNA，并且在采集了幾個(gè)不同的樣本后，該團(tuán)隊(duì)能夠識(shí)別富含DNA的利基。這可以使未來研究中更容易從化石骨骼中提取更多古老的DNA。
        

        研究人員建議，結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)和尖端技術(shù)，每種技術(shù)都針對(duì)單個(gè)樣品的特性進(jìn)行定制，這將使古代DNA樣品的測(cè)序具有前所未有的準(zhǔn)確性。
        

        “我們可以進(jìn)一步改善古代DNA的tSMS，”Ludovic說，“通過利用酶處理來獲取當(dāng)前協(xié)議遺漏的分子。”
        
			

			
          
        
			
        
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