西班牙的一個研究小組成功地對伊比利亞ly((Lynx pardinus)的基因組進(jìn)行了測序和分析，這是世界上最瀕危的貓科動物，也是瀕臨滅絕的物種的獨(dú)特例子。

伊比利亞ly is是四種現(xiàn)存的ly species物種之一，它們有著短的尾巴，斑點(diǎn)的外套，強(qiáng)壯的身體，長腿，以及特有的簇狀耳朵和類似胡須的褶皺。

也被稱為西班牙ly ,,這個物種只有歐亞ly((Lynx lynx)大小的一半，并且在尺寸上更接近加拿大ly((Lynx canadensis)和山貓(Lynx rufus)。

伊比利亞和歐亞ly is是姊妹物種和歐亞大陸的兩個現(xiàn)存的ly ..與大型的，通用的和廣泛的歐亞ly，相比，伊比利亞ly is更小，是棲息地和獵物專家，僅限于伊比利亞半島的地中海地區(qū)，在那里它們幾乎完全捕食歐洲兔(Oryctolagus cuniculus)。

據(jù)說曾經(jīng)相當(dāng)豐富并且廣泛分布在整個伊比利亞半島，在20世紀(jì)下半葉急劇下降，在Doñana和Andújar兩個孤立的種群(Sierra Morena)中分布的不到100個人(少于62個成熟)在西班牙南部的安達(dá)盧西亞，它被認(rèn)為是世界上最瀕危的貓科動物，并被列為2002年，2006年和2008年世界自然保護(hù)聯(lián)盟紅色名錄中的“極度瀕危”。

根據(jù)本周發(fā)表在基因組生物學(xué)雜志上的一項新的遺傳分析，伊比利亞lyin擁有哺乳動物中最不同的基因組之一。

這項由西班牙國家研究委員會Doñana生物站研究員JoséGodoy博士領(lǐng)導(dǎo)的研究作者對一名名叫Candiles的伊比利亞男性的基因組草案進(jìn)行了測序，組裝和注釋，并重新測序了另外十名伊比利亞人和一名伊比利亞人。歐亞lyx基因組。

此外，為了獲得基因表達(dá)數(shù)據(jù)并輔助基因注釋，他們表征了11個lynx組織的轉(zhuǎn)錄組。

“我們成功地閱讀并組織了來自Candiles的24億個DNA信件，這是一種出生在Sierra Morena lynx種群中的雄性ly ,,”作者說。

“為此，我們使用新的測序技術(shù)并開發(fā)了創(chuàng)新的程序來生成高質(zhì)量的草圖基因組。”

共鑒定出21,257個基因，其數(shù)量與人類和其他哺乳動物相似，并與貓，老虎，獵豹和狗進(jìn)行了比較。

“具體來說，我們將伊比利亞lynx基因組與其他物種的基因組進(jìn)行了比較，試圖找出失去其功能的基因，因為它們一直處于孤立狀態(tài)，并存在少量這一物種的標(biāo)本，”科學(xué)家說。

他們發(fā)現(xiàn)了與聽覺，視覺和嗅覺相關(guān)的基因修飾的證據(jù)，以促進(jìn)ly to對其環(huán)境的適應(yīng)，這使他們成為專門用作兔子的特殊獵人。

“為了研究物種的歷史和遺傳多樣性，對來自Doñana和Sierra Morena的另外10只伊比利亞ly in的基因組進(jìn)行了分析，這是伊比利亞半島上唯一存活下來的兩個人口，它們之間是相互隔離的。幾十年來，“作者說。

該團(tuán)隊還完成了與歐洲ly in的比較分析，以發(fā)現(xiàn)居住在歐亞大陸的兩個ly in之間的聯(lián)系。

“伊比利亞猞猁開始從它的姊妹品種約30萬年前出現(xiàn)分歧，這兩個品種完全成了一些2500年前分離，”研究人員說。

“在此期間，當(dāng)氣候?qū)W允許物種在伊比利亞半島和歐洲南部相互傳播和相遇時，它們可能繼續(xù)交叉繁殖和交換基因，可能是在冰川之間的時期。”

科學(xué)家還發(fā)現(xiàn)了伊比利亞山羊歷史上一系列嚴(yán)重的人口瓶頸，這些瓶頸在20世紀(jì)已知的人口統(tǒng)計學(xué)衰退之前就已經(jīng)發(fā)生，并且對其基因組進(jìn)化產(chǎn)生了極大的影響。

他們解釋說：“伊比利亞ly has的人口歷史以三次歷史性下降為標(biāo)志，其中最后一次發(fā)生在大約300年前，人口大幅減少。”“除此之外，20世紀(jì)由于受到迫害，棲息地遭到破壞，以及主要食物來源兔子遭受兩次主要的病毒感染，標(biāo)本數(shù)量急劇下降。”

該團(tuán)隊將這些人口下降解釋為觀察到的低水平多樣性的原因，并警告說這可能會削弱lynx適應(yīng)環(huán)境變化的能力。

“此外，確認(rèn)存在多種潛在有害的遺傳變異，這可能有助于降低該物種的存活率和繁殖率，”他們說。

“這種遺傳變異在多納納人群中尤其顯著 - 較小，并且分離的時間較長 - 這一點(diǎn)具有塞拉莫雷納群體遺傳多樣性的一半。”

“然而，這項研究反映了兩個孑遺種群之間交換之前的狀況，以及它們在圈養(yǎng)中的相互繁殖。”

“這些措施是在伊比利亞山地保護(hù)計劃中采取的，近年來已經(jīng)改善了該物種的遺傳狀況。”