自推出以來(lái)近四年，臨床測(cè)序探索性研究(CSER)計(jì)劃在確定基因組學(xué)在醫(yī)學(xué)中的作用方面取得了重大進(jìn)展。CSER研究人員發(fā)現(xiàn)了基因組變異 - DNA代碼的差異 - 可能導(dǎo)致疾病; 改進(jìn)了DNA測(cè)序結(jié)果的分析和解釋; 并提供了在臨床護(hù)理中使用基因組學(xué)的倫理，法律和社會(huì)影響的新見(jiàn)解。

CSER - 由國(guó)家人類(lèi)基因組研究所(NHGRI)和國(guó)家癌癥研究所資助，這兩個(gè)部分都是國(guó)立衛(wèi)生研究院 - 即將結(jié)束其第一輪研究獎(jiǎng)。為了幫助確定潛在的后續(xù)計(jì)劃的方向，CSER研究人員和同事最近在馬里蘭州貝塞斯達(dá)召開(kāi)了為期一天的會(huì)議，將基因組測(cè)序納入臨床護(hù)理：CSER和Beyond。

會(huì)議重點(diǎn)關(guān)注該計(jì)劃的目標(biāo)和成就，并確定未來(lái)5到10年內(nèi)可在臨床測(cè)序計(jì)劃中解決的未來(lái)挑戰(zhàn)和機(jī)遇的優(yōu)先順序。例如，為了加強(qiáng)在臨床中使用基因組測(cè)序的案例，發(fā)言者認(rèn)為必須繼續(xù)建立將遺傳構(gòu)成與疾病聯(lián)系起來(lái)的證據(jù)，并更好地理解基因組測(cè)序使用與疾病結(jié)果之間的關(guān)系。其他人強(qiáng)調(diào)了改進(jìn)標(biāo)準(zhǔn)以確定變體的作用以及它們?cè)诨颊卟∏橹械淖饔玫闹匾?。?huì)議參與者建議更多地研究基因組測(cè)試對(duì)患者和家屬的影響，以及如何向他們提供這些信息。

“CSER檢查患者的基因組信息對(duì)患者及其家人的真正意義。它還研究了患者與醫(yī)療從業(yè)人員和臨床實(shí)驗(yàn)室的互動(dòng)如何告知基因組信息應(yīng)如何應(yīng)用于臨床護(hù)理，”Lucia Hindorff博士說(shuō)。 .D。，NHGRI基因組醫(yī)學(xué)部CSER項(xiàng)目主任。

雖然許多演講展望未來(lái)，但一些CSER研究的潛在影響更為直接。在一項(xiàng)研究中，密歇根大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)了兒童癌癥中DNA測(cè)序的益處。在另一個(gè)例子中，北卡羅來(lái)納大學(xué)教堂山分校的研究人員使用DNA測(cè)序來(lái)幫助診斷和治療患有肌張力障礙的女性，這是一種疼痛的肌肉疾病。波士頓Dana-Farber癌癥研究所的科學(xué)家開(kāi)發(fā)了一種計(jì)算機(jī)程序，根據(jù)癌癥的重要性對(duì)患者的基因組突變和變異進(jìn)行分類(lèi)和排序，可能有助于指導(dǎo)治療。

從證明DNA測(cè)序事項(xiàng)到處理意外結(jié)果

在一次會(huì)議期間，研究人員討論了臨床DNA測(cè)序?qū)颊咦o(hù)理產(chǎn)生影響的證據(jù)的必要性。研究人員表示，在醫(yī)生，患者和醫(yī)療保健系統(tǒng)支持使用DNA測(cè)序之前，臨床醫(yī)生需要證據(jù)表明，與其他方法相比，它可以改善護(hù)理并且具有成本效益和時(shí)間效益。

合伙醫(yī)療中心和波士頓布萊根婦女醫(yī)院分子醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室主任Heidi Rehm博士表示，描述基因和變異臨床相關(guān)性的綜合資源才剛剛開(kāi)始發(fā)展。她補(bǔ)充說(shuō)，CSER有機(jī)會(huì)在患者護(hù)理中建立基因組學(xué)和基因組檢測(cè)的“證據(jù)基礎(chǔ)”。

目前，關(guān)于醫(yī)生可以對(duì)引起疾病的變異或基因突變的信息做什么的建議有限。Rehm博士說(shuō)，準(zhǔn)確定義患者的疾病并了解DNA測(cè)序中發(fā)現(xiàn)的變異的作用是一項(xiàng)挑戰(zhàn)。

“我們需要為基因組測(cè)試開(kāi)發(fā)新的工具和標(biāo)準(zhǔn)。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該協(xié)同工作，共享數(shù)據(jù)并標(biāo)準(zhǔn)化解釋變體意味著什么以及它們?nèi)绾螌?dǎo)致疾病，”Rehm博士說(shuō)。

幾位發(fā)言者談到了改進(jìn)這種解釋的必要性。他們說(shuō)，研究人員往往留下一個(gè)令人不滿(mǎn)意和不確定的結(jié)果，被稱(chēng)為“具有不確定意義的變種”。

西雅圖華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)系主任Gail Jarvik醫(yī)學(xué)博士說(shuō)：“為了使基因組醫(yī)學(xué)有效和安全，我們需要知道變種的作用。” “我們必須就解釋它們的一致方式達(dá)成一致。”

一些與會(huì)者強(qiáng)調(diào)，需要在疾病基因組研究中充分代表不同人群。北卡羅來(lái)納大學(xué)教堂山分校遺傳學(xué)和醫(yī)學(xué)博士杰森·埃文斯博士提到了許多理由，包括在基因組學(xué)研究中包括少數(shù)和醫(yī)學(xué)服務(wù)不足的人群，包括減少健康差異和行為的必要性好科學(xué)。

“臨床上，我們需要確保識(shí)別疾病相關(guān)變異的進(jìn)展能夠傳播給所有人群，”他說(shuō)。“我們還需要確保少數(shù)群體的參與，以使調(diào)查結(jié)果有用，因?yàn)樽儺悩?gòu)成的差異可能針對(duì)具有不同祖先背景的人群。”

CSER由九項(xiàng)研究資助和一項(xiàng)NHGRI校內(nèi)研究計(jì)劃組成。每一個(gè)都涉及招募患者的臨床和技術(shù)問(wèn)題，產(chǎn)生臨床基因組測(cè)序數(shù)據(jù)以及從基因組測(cè)試中收集的信息的社會(huì)影響和心理影響。該聯(lián)盟還包括九個(gè)小組，專(zhuān)注于了解向患者和家屬返回基因組檢測(cè)結(jié)果的倫理，法律和社會(huì)復(fù)雜性。基因組檢測(cè)結(jié)果的返回并不是一個(gè)簡(jiǎn)單的過(guò)程，因?yàn)榛蚪M檢測(cè)總是會(huì)出現(xiàn)意外 - 以及所謂的偶然結(jié)果。

與會(huì)者得出結(jié)論認(rèn)為，如何處理偶然發(fā)現(xiàn)的問(wèn)題仍然是一個(gè)挑戰(zhàn)。雖然CSER研究人員和其他人能夠?qū)蚪M和整個(gè)外顯子組(基因組的蛋白質(zhì)編碼部分)進(jìn)行測(cè)序，但Rehm博士建議，最近可能會(huì)過(guò)多強(qiáng)調(diào)將“預(yù)測(cè)”信息返回給醫(yī)生和患者“當(dāng)我們的能力預(yù)測(cè)疾病的發(fā)展是如此有限。“

在總結(jié)會(huì)議中，與會(huì)者談到了許多與基因組醫(yī)學(xué)相關(guān)的主題，從監(jiān)管機(jī)構(gòu)的角色到公眾的看法。

納什維爾范德比爾特大學(xué)醫(yī)學(xué)院個(gè)性化醫(yī)學(xué)助理副校長(zhǎng)Dan Roden表示，盡管使用基因組測(cè)序技術(shù)存在挑戰(zhàn)，但“我們不應(yīng)忽視該技術(shù)在醫(yī)學(xué)方面的作用”。特別是對(duì)于難以診斷的疾病。

埃文斯博士說(shuō)：“這些問(wèn)題已經(jīng)從”我們能否將臨床基因組學(xué)整合到患者護(hù)理中“轉(zhuǎn)變?yōu)?rdquo;我們?cè)鯓硬拍茏龅酶?，價(jià)值更高“。“CSER非常有能力認(rèn)真思考這些挑戰(zhàn)。我們現(xiàn)在開(kāi)始尋找這些問(wèn)題的答案。這是一個(gè)令人難以置信的激動(dòng)人心的時(shí)刻。”