研究人員組裝歐亞鱸魚基因組
n G3最近發(fā)表在《科學雜志》上的一項研究:基因、基因組,遺傳學,愛沙尼亞生命科學大學的研究人員與圖爾庫大學的同事們合作,歐亞鱸魚基因組組裝。三次小于人類基因組,但包含大約10億個核苷酸和超過23000個基因。調(diào)查鱸魚源自湖的黑暗水域Loosalu Rapla縣的沼澤中。研究的結(jié)果使世界各地的科學家們更好地理解自然選擇的影響。
歐亞鱸魚是一種很常見的魚類在愛沙尼亞和歐亞大陸。其棲息地范圍從俄羅斯遠東地區(qū)的不列顛群島。這個物種可以在極端環(huán)境條件下生存并成功地繁殖。因此,棲息在貧營養(yǎng)湖泊水上,波羅的海的微咸水和酸性黑暗的水沼澤湖泊其他魚類無法生存。然而,它還不知道什么遺傳機制幫助上適應這種不同的生活條件。
鱸魚是一個重要的鏈接在水體的食物鏈。此外,條紋魚有巨大影響甲烷循環(huán)的湖泊,湖泊幾乎10倍的甲烷排放量減少改變食物鏈。由于甲烷是一種比二氧化碳更有效的溫室氣體,鱸魚的扮演著一個重要的角色在減少全球變暖。“這是特別重要的是理解為什么棲息在沼澤湖泊的適應機制缺乏氧氣(富含腐殖質(zhì)物質(zhì)),甲烷排放是最高和鱸魚的往往是唯一的魚類,”魚類學家反Vasemagi說,瑞典農(nóng)業(yè)科學大學的教授、高級研究員愛沙尼亞生命科學大學領(lǐng)導這項研究。
根據(jù)Vasemagi,組裝基因組是一個重要的里程碑。“與以前研究的魚類相比,高價值的基因組,我們用創(chuàng)新的方法基于單獨的長的DNA分子標記和確定的序列短,“Vasemagi說。
科學家說,應用方法允許快速基因組測序更大,相對便宜,準確地說,在極其困難的任務匹配的基因組分為數(shù)以百萬計的小游戲。因此,它終于可以覆蓋整個基因組進行研究不同的魚類。Vasemagi補充說,最簡單的方法用于抓住基因組的大小將其測量人類可以理解的。“如果你想象一個堿基對是1毫米的長度,鱸魚基因組可以達到從塔爾圖到柏林,”他說,補充說,研究小組的下一個任務是繪制基因組區(qū)域,或公里路線從塔爾圖到柏林,包含自然選擇的痕跡。
更重要的是,鱸魚是一個重要的商業(yè)利用魚類和休閑漁民中也是一個非常受歡迎的目標。在歐洲廣泛養(yǎng)殖在很多地方。鱸魚基因組的測序”使科學家們繪制的基因組區(qū)域,影響魚類的生長速率,達到性成熟,抵抗疾病,和其他重要的水產(chǎn)養(yǎng)殖特點,“總值Riho教授說,愛沙尼亞大學水產(chǎn)養(yǎng)殖的椅子上生命科學。“鱸魚基因組的測序?qū)⒑喕愃频难芯吭诒泵?我們棲息的近親,黃色的鱸魚(拉丁名如蛾)是廣泛的?;蚪M測序鱸魚只是第一步理解進化機制有了棲息最成功的和廣泛的魚類在歐亞大陸溫帶,”Vasemagi總結(jié)道。
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