基因組測序取代了標(biāo)準(zhǔn)耐藥性測試

來自CRyPTIC聯(lián)盟的國際研究團隊在抗擊結(jié)核病方面取得了重要進展：對10,000多種病原體菌株進行的大規(guī)?；蚪M分析表明，基因組測序可以改善結(jié)核病治療。此外，該方法有可能取代時間密集的表型抗性測試。這項由牛津大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的研究結(jié)果發(fā)表在最新一期的“ 新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志”上。

結(jié)核病(TB)是世界上最致命的傳染病。根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的最新報告，去年約有1000萬人感染結(jié)核病，160萬人死于感染后果。

結(jié)核病治療的一個主要問題是多藥耐藥菌株(MDR-TB)的發(fā)生率增加，這些菌株對常用藥物不再敏感。及時診斷耐藥性對治療成功至關(guān)重要。經(jīng)典抗性測試涉及在含有抗生素的培養(yǎng)基中培養(yǎng)細(xì)菌，目前需要數(shù)周時間。此外，這些測試并未在結(jié)核病發(fā)病率高的許多國家使用。因此，許多患者采用錯誤的藥物組合，隨后治愈和生存的機會較低。迫切需要更快速和實用的電阻測試方法。

CRyPTIC研究檢查了來自16個國家的10,000多個細(xì)菌基因組。Leibniz肺中心研究中心Borstel(FZB)捐贈了來自德國，非洲和中亞的600多種TB菌株的數(shù)據(jù)，并參與了數(shù)據(jù)評估。

該研究也于2018年9月26日在紐約舉行的聯(lián)合國大會結(jié)核病高級別會議上發(fā)表，該研究表明，病原體基因組的變化可用于非常準(zhǔn)確地預(yù)測對標(biāo)準(zhǔn)一線藥物的耐藥性?；蚪M測序可以精確和單獨地確定所需的藥物組合，并節(jié)省標(biāo)準(zhǔn)抗性測試中使用的資源。FZB研究人員還致力于在中亞和非洲的參考實驗室建立基因組分析。

“這項研究數(shù)據(jù)為結(jié)核病診斷學(xué)開發(fā)了新的概念。另外，常用藥物的標(biāo)準(zhǔn)耐藥性測試很快就會被基于基因組的方法所取代。這是一個里程碑，也是抗擊耐多藥結(jié)核病的范式轉(zhuǎn)變，” FZB的CRyPTIC研究負(fù)責(zé)人，德國感染研究中心(DZIF)結(jié)核病研究領(lǐng)域的協(xié)調(diào)員Stefan Niemann說。

在英格蘭，荷蘭和紐約沃茲沃思公共衛(wèi)生中心，結(jié)果已經(jīng)導(dǎo)致細(xì)菌培養(yǎng)物用于抗性測試的減少以及完全基于基因組測序結(jié)果的治療開始。在德國，Robert Koch研究所和FZB目前正在籌劃一項試點研究，以評估基因組測序在診斷和監(jiān)測方面的全國適用性。

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