在愛好太陽的細菌中光合作用的起源出現(xiàn)了新的圖景
如果只有我們能夠更有效地捕獲所有能量,每天都有足夠的陽光照射地球,為地球提供多次動力。由于今天的太陽能電池板效率受到限制(目前,超過80%的可用太陽能作為熱量損失),科學家們一直在研究自然界,以便更好地了解光合作用植物和細菌捕獲陽光的方式。
“大自然的光合作用發(fā)明是驅(qū)動生物圈的最重要的能量轉(zhuǎn)換過程,光合作用永遠改變了地球的大氣層,”亞利桑那州立大學生物設(shè)計研究所應用結(jié)構(gòu)生物學中心和分子學院的副研究教授Raimund Fromme說??茖W。
超過30億年前,我們的星球沒有氧氣。在這個時候,大自然想出了一種捕捉陽光并將其轉(zhuǎn)化為食物的方法,以利用這種永恒的能源。
現(xiàn)在,由Fromme領(lǐng)導的一個研究小組通過近原子清晰度解決了重要的新見解,這是最簡單的已知光合細菌中的第一個核心膜蛋白結(jié)構(gòu),稱為Heliobacterium modesticaldum(Helios是希臘太陽神)。
通過解決這種愛好陽光的土壤細菌的光合作用的核心,F(xiàn)romme的研究團隊對光合作用的早期進化以及植物系統(tǒng)之間這一重要過程的不同有了新的認識。
他們的發(fā)現(xiàn)為科學家提供了一個全新的模板,為有機太陽能電池板設(shè)計奠定了基礎(chǔ),被稱為太陽能“人造葉子”,或可能的可再生生物燃料應用。
研究結(jié)果發(fā)表在今天的“科學”雜志上。
大自然最了解
亞利桑那州立大學長期以來一直是光合作用的長期研究領(lǐng)導者,可以追溯到20世紀70年代作為研究型大學的第一個十年。對于那些被索諾蘭沙漠獨特美景吸引的科學家來說,這是一個天生的選擇,它擁有300多天的年度日照,是全國捕獲太陽能的最佳地點。
生命的太陽能電池板,科學家稱之為光系統(tǒng),被植物,藻類和光合細菌用作一種非常有效的系統(tǒng),用于捕獲幾乎所有可利用的光子生長和茁壯成長,幾乎填滿了地球上的每個角落。
Fromme是亞利桑那州立大學大型結(jié)構(gòu)生物學研究小組的成員,他們通過拍攝光合作用反應中心內(nèi)的關(guān)鍵蛋白質(zhì)來幫助將光轉(zhuǎn)化為能量,從而逐步獲得更好的理解。
“為了真正完全理解光合作用,人們必須遵循將光轉(zhuǎn)化為化學能的過程,”Fromme說。“這是有史以來研究最快的化學反應之一,這也是研究和理解這么難的一部分。”
相比之下,光合作用的時間尺度將閃電般的光線變成了類似蝸牛的速度。光合作用反應發(fā)生在皮秒級,即1萬億分之一秒。皮秒是一秒鐘,一秒鐘是37,000年。
但ASU結(jié)構(gòu)生物學家正在使用更強大的X射線技術(shù),通過在整個過程中捕獲結(jié)晶蛋白的凍結(jié)圖像,有朝一日追趕光。
閃電在一個瓶子里
為了研究光合作用,F(xiàn)romme探索了最簡單形式的光合作用,即最近在溫泉附近的泥質(zhì)土壤中發(fā)現(xiàn)的heliobacteria。
單細胞的heliobacteria比植物更簡單,但根本不同。例如,在光合作用期間,而不是使用像植物一樣的水,heliobacteria使用硫化氫。它們在沒有氧氣的情況下生長,在光合作用后,發(fā)出腐臭的雞蛋氣味代替氧氣。
Heliobacteria利用其獨特的地方成功地開辟了自己的生態(tài)位,因為它們使用近紅外波長的光進行光合作用,這對于冰島或泥水稻田等低光照條件非常適合。植物根本無法競爭。
科學家們想要了解日光桿菌如何實現(xiàn)這一目標。
對行動的反應
光合作用的核心是反應中心;它是一種精細的顏料和蛋白質(zhì)復合物,可將光轉(zhuǎn)化為電子,為細胞提供動力。
葉綠素是使植物變綠的色素。在植物中,葉綠素捕獲太陽的能量,并利用它從空氣和水中產(chǎn)生二氧化碳。
高等植物,綠藻和藍細菌的氧合成光合作用利用光照系統(tǒng)I(PSI),它是I型RC,和光系統(tǒng)II(PSII),它是II型RC。這些一起工作以從水中提取電子到鐵氧還蛋白,并最終將能量載體NADP +還原為NADPH。
相比之下,無氧光養(yǎng)細菌,如Heliobacterium modesticaldum,使用單個RC來驅(qū)動循環(huán)電子轉(zhuǎn)移(ET)途徑,該途徑在膜上產(chǎn)生質(zhì)子動力,其用于通過ATP合成驅(qū)動能量產(chǎn)生和代謝。
反應中心將這些參與者包圍成籠子,通過將所有元素組合在一起,有效地捕獲所有可用的能量和光子。
反應中心(RC)有兩種主要的輔助因子:鐵(I型)或醌(II型)。
Heliobacteria具有最簡單的已知反應中心并使用獨特的葉綠素。
heliobacteria的發(fā)現(xiàn)導致其RC的獨特特征的鑒定(在20世紀90年代,前ASU化學主席Robert Blankenship首先領(lǐng)導了一個小組來幫助序列和表征heliobacteria RCs)。
已經(jīng)提出,heliobacteria RC是最接近所有光合作用反應中心最早共同祖先的物種,當大約30億年前,早期地球含有富含硫的海洋和少量氧氣。
但成功純化RC蛋白和生長X射線實驗所需的晶體可能是一個漫長而艱難的過程。
特別是,F(xiàn)romme的研究項目是在七年前開始的,因為博士后研究員Iosifina Sarrou首先改進了heliobacterial反應中心的制備。經(jīng)過許多初步的結(jié)晶試驗后,發(fā)現(xiàn)了X射線衍射晶體電荷。
“這是晶體學家正在等待的那一刻,”Fromme說,他解釋了生長適合X射線研究的完美蛋白質(zhì)晶體所需的時間。
兩個探戈
在這些令人鼓舞的結(jié)果之后,Christopher Gisriel加入了團隊并將衍射質(zhì)量提高到2.2埃的最終質(zhì)量。
盡管如此,研究小組還是無法解決晶體結(jié)構(gòu)問題。
這次中斷需要兩年時間,直到2016年8月。然后,終于有了突破。
在這一點上“隨著每個新的葉綠素受到歡呼,”在未知領(lǐng)域開始了驚心動魄的發(fā)現(xiàn),“Fromme記得,并”證明了每個人對heliobacteria的RC的初步預測是錯誤的。“
使用位于加利福尼亞州伯克利的先進光源的X射線光,以及位于伊利諾伊州阿貢國家實驗室的高級光子源的光束線,F(xiàn)romme的小組現(xiàn)在已經(jīng)在近原子上首次可視化了heliobacteria RC,2.2-埃分辨率(埃是氫原子的寬度)。
他們在heliobacter RC中發(fā)現(xiàn)了幾乎完美的對稱性。
首先,一對蛋白質(zhì)的氨基酸組成相同,稱為同型二聚體。
這是第一次發(fā)現(xiàn)RC只含有一對蛋白質(zhì)同型二聚體來驅(qū)動光合作用。
最后,他們將大約60個葉綠素映射到RC蛋白復合物上,這最終比他的研究預測的Pennstate大學的同事John Golbeck高出許多。
核心多肽二聚體和兩個小亞基配位54個(細菌)葉綠素和2個類胡蘿卜素,它們在反應中心捕獲能量并將能量轉(zhuǎn)移到核心,進行電荷分離,穩(wěn)定化和電子轉(zhuǎn)移,它由6個(細菌)葉綠素和鐵組成。 - 硫簇;與其他反應中心不同,它缺乏結(jié)合的醌。
因此,該結(jié)構(gòu)支持這樣的假設(shè),即HbRC中的電子傳遞不需要中間輔助因子。
“已經(jīng)從多種異二聚體(多于一種蛋白質(zhì))的RC(紫色細菌RC,PSI和PSII)獲得了高分辨率結(jié)構(gòu),但直到現(xiàn)在還沒有解決同型二聚體RC結(jié)構(gòu),”Fromme說。
光合作用的古老起源
此外,隨著DNA測序技術(shù)的爆炸式增長,以及能夠了解生命中所有基因和蛋白質(zhì)的潛在能力,他們還追蹤了光合作用RC的進化。
這個反應中心能否催生所有其他反應中心,導致更多的復雜性?
在進化學術(shù)語中,這意味著heliobacteria RC可能首先來自單個基因。
“這種結(jié)構(gòu)保留了祖先反應中心的特征,提供了對光合作用進化的洞察力,”Fromme的同事Kevin Redding解釋道。“從我們擁有的新結(jié)構(gòu)來看,對于一個引人注目的案例肯定是有道理的。”
然后,該基因可能已被復制以增加進化復雜性。
“同源二聚體RC在進化過程中幾乎肯定先于異二聚體RCs,”Fromme說。核心RC亞基基因的復制隨后兩個基因的分歧將允許同型二聚體轉(zhuǎn)化為異二聚體RC。這可能發(fā)生在至少三個不同的場合,導致在其他光合細菌和植物中發(fā)現(xiàn)所有不同的和更復雜的反應中心。“
太陽將再次升起
Fromme的小組對新結(jié)果的潛力感到興奮。這樣的理解可以在一天之內(nèi)幫助世界各地的研究小組建立一個人工光合作用中心,可以幫助開發(fā)下一代混合有機太陽能電池板,可能使用heliobacter來增強光吸收并開始提高太陽能效率或驅(qū)動太陽能可再生生物燃料技術(shù)。
畢竟,明天太陽將再次升起,等待越來越多聰明的技術(shù),科學家們可以夢想捕捉太陽能的全部潛力。
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