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        亞洲鯰魚基因組解碼
        
			
        
				2019-03-14 11:24:53
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        條紋鯰魚Pangasianodon hypophthalmus位于傳說中的湄公河，是東南亞最長的河流，也是世界上最大的內(nèi)陸漁業(yè)。越南是該物種的主要生產(chǎn)國，在一年內(nèi)培育了約110萬噸魚。但與其他商業(yè)魚類不同，例如大西洋鱈魚或斑點鯰魚，很少有基因組數(shù)據(jù)來指導(dǎo)條紋鯰魚養(yǎng)殖。
        

        亞洲鯰魚基因組解碼
        

        現(xiàn)在，沖繩科學(xué)技術(shù)研究生院(OIST)的科學(xué)家們與越南科學(xué)技術(shù)研究院的研究人員合作，對條紋鯰魚的整個基因組進(jìn)行解碼。他們的結(jié)果于2018年10月5日發(fā)表在BMC Genomics上，揭示了該物種的進(jìn)化譜系和可能是其健康發(fā)育關(guān)鍵的基因的新細(xì)節(jié)。
        

        “通過這些基因組數(shù)據(jù)，可以很容易地檢查個體鯰魚種群中存在的多樣性，”OIST海洋基因組學(xué)組組長，該研究的共同第一作者Eiichi Shoguchi說。“例如，在水產(chǎn)養(yǎng)殖中，單個魚對疾病的抵抗力可能高于另一個?，F(xiàn)在，您可以檢查個體的基因組并了解哪個基因與抗病性有關(guān)。”
        

        利用下一代測序技術(shù)，研究人員收集了高質(zhì)量的基因組數(shù)據(jù)并將其組裝成完整的基因組。他們將新基因組與之前發(fā)表的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較，這些數(shù)據(jù)來自斑點叉尾and和斑馬魚 - 一種與鯰魚密切相關(guān)的模式生物，在進(jìn)化上?？茖W(xué)家們發(fā)現(xiàn)了亞洲鯰魚和它的美國表親之間的明顯差異，以及它與斑馬魚相關(guān)的進(jìn)一步差異。
        

        特別是，他們發(fā)現(xiàn)條紋鯰魚中兩個基因的丟失在斑馬魚中保持完整，并允許該物種產(chǎn)生自己的防曬劑。鯰魚在河流底部進(jìn)食，超出紫外線范圍，可能不需要這種保護(hù)。條紋鯰魚確實比斑馬魚有更多的胰島素樣生長因子基因，這可能是其健康生長和發(fā)育的關(guān)鍵。
        

        科學(xué)家利用來自鯰魚的數(shù)據(jù)，制作了一個假設(shè)的條紋鯰魚染色體圖譜 - 這種魚類的基因所在的線狀腳手架。該地圖指出了未來研究的方式，比較物種，追蹤其譜系和調(diào)查其基因功能。進(jìn)化生物學(xué)家和水產(chǎn)養(yǎng)殖者都可以從條紋鯰魚基因組中學(xué)習(xí)，現(xiàn)在它已經(jīng)被解碼了。
        

        在不久的將來，水產(chǎn)養(yǎng)殖者可以開始尋找并選擇最佳的DNA片段，稱為“分子標(biāo)記”，在他們自己的條紋鯰魚中，越南學(xué)院基因組研究所的實驗室負(fù)責(zé)人Oanh TP Kim說?？茖W(xué)技術(shù)和該研究的共同第一作者。
        

        “條紋鯰魚的基因組信息將使我們能夠”開發(fā)這些分子標(biāo)記，然后將它們應(yīng)用于分子標(biāo)記輔助選擇，以獲得鯰魚養(yǎng)殖中具有經(jīng)濟(jì)重要性的特征。“
        
			

			
          
        
			
        
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