了解染色質(zhì)的癌癥連接
當(dāng)科學(xué)家在2003年完成對人類基因組的解碼時(shí),他們認(rèn)為這些發(fā)現(xiàn)將有助于我們更好地了解疾病,發(fā)現(xiàn)與癌癥相關(guān)的基因突變,并導(dǎo)致智能醫(yī)學(xué)的設(shè)計(jì)?,F(xiàn)在是13年之后,并非所有這些想法都沒有實(shí)現(xiàn)。“我們認(rèn)為理解基因會(huì)回答我們所有的問題,”西北工程公司的Vadim Backman說道。“但事情并非那么簡單。”
事實(shí)證明,基因只是一個(gè)更大的難題的一部分。為了幫助解決這個(gè)難題,Backman開發(fā)了一種新的圖像染色質(zhì)的方法,染色質(zhì)是一種大分子復(fù)合物,包括DNA,RNA和蛋白質(zhì) - 在活細(xì)胞內(nèi)容納遺傳信息并確定哪些基因得到表達(dá)。
“如果你認(rèn)為細(xì)胞系統(tǒng)是計(jì)算機(jī),那么基因就是硬件,染色質(zhì)就是軟件,”西北大學(xué)McCormick工程學(xué)院的Walter Dill Scott工程學(xué)教授Backman說。
染色質(zhì)的組織在許多分子過程中起主要作用,包括DNA轉(zhuǎn)錄,復(fù)制和修復(fù)。染色質(zhì)中調(diào)節(jié)這些過程的結(jié)構(gòu)從核小體(10納米)到染色體(長于200納米)長度范圍。
由于缺乏成像技術(shù),染色質(zhì)在這些長度尺度之間的動(dòng)態(tài)變化知之甚少。因?yàn)樗鼈冃枰卸镜臒晒馊玖蟻碓鰪?qiáng)對比度,所以先前的技術(shù)不能在活細(xì)胞中成像染色質(zhì)而不會(huì)殺死或擾亂細(xì)胞。然而,理解這個(gè)缺失的長度尺度是至關(guān)重要的,因?yàn)樗侨旧|(zhì)在癌癥形成時(shí)經(jīng)歷轉(zhuǎn)化的確切區(qū)域。
“染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化與通常與癌癥有關(guān)的基因調(diào)控有關(guān),”巴克曼說。“染色質(zhì)的組織與腫瘤的形成及其侵襲性有關(guān)。我們想了解染色質(zhì)如何調(diào)節(jié)這些基因。”
Backman的新成像技術(shù)使研究人員能夠以缺失的,神秘的長度尺度(20-200納米)觀察染色質(zhì)內(nèi)部。該技術(shù)不僅沒有標(biāo)簽,而且允許研究人員在未受破壞的活細(xì)胞內(nèi)研究染色質(zhì),但它以高通量和非常低的成本進(jìn)行研究。
該研究由美國國家科學(xué)基金會(huì),國立衛(wèi)生研究院和芝加哥生物醫(yī)學(xué)聯(lián)盟支持,于10月4日在線發(fā)表在“ 美國國家科學(xué)院院刊”上。Luay Almassalha,Greta Bauer,John Chandler和Scott Gladstein,所有Backman實(shí)驗(yàn)室的研究生,都是該論文的共同第一作者。西北工程公司的Igal Szleifer,生物醫(yī)學(xué)工程的Christine Enroth-Cugell教授和生物醫(yī)學(xué)工程研究助理教授Hariharan Subramanian也為這項(xiàng)工作做出了貢獻(xiàn)。
“現(xiàn)在我們可以不受干擾地觀察活的,健康的細(xì)胞,看看它們的動(dòng)態(tài)過程,”Almassalha說。“我們可以看到染色質(zhì)是如何組織的,以及它如何響應(yīng)刺激,如藥物治療。”
該技術(shù)稱為活細(xì)胞部分波光譜(PWS)顯微鏡,通過使用散射光檢測染色質(zhì)。小于光的衍射極限的粒子不能被可視化,但是可以通過分析它們散射的光來感測它們的存在和組織。該方法可以在幾秒鐘內(nèi)測量活細(xì)胞中的納米結(jié)構(gòu),為大規(guī)模屏幕打開了大門。例如,研究人員可以對數(shù)千種化合物和藥物進(jìn)行高通量篩選,并觀察它們?nèi)绾螌?shí)時(shí)影響細(xì)胞。
“我們知道染色質(zhì)是復(fù)雜疾病的主要參與者,”巴克曼說。“我們還沒有研究它的技術(shù)。現(xiàn)在我們可以觀察和記錄這些動(dòng)態(tài)過程。”
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