解碼的基因組可能有助于烏龜贏得種族生存
踏實(shí)和穩(wěn)重是贏得比賽的關(guān)鍵。雖然在伊索的經(jīng)典寓言之一中可能也是如此,但莫哈韋沙漠龜可能需要比過(guò)去幾十年更快地適應(yīng)。該物種正面臨著生存的嚴(yán)重威脅,從入侵植物到人為的景觀變化。
但亞利桑那州立大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院的研究人員及其合作者可能會(huì)有一種新工具來(lái)幫助保護(hù)這種標(biāo)志性的沙漠爬行動(dòng)物。他們第一次解碼了動(dòng)物的基因組;他們的研究結(jié)果發(fā)表在PLOS ONE期刊的最新一期。這一突破可以幫助動(dòng)物抵御越來(lái)越多的威脅。
“美國(guó)地質(zhì)調(diào)查局的研究生態(tài)學(xué)家和陸龜專(zhuān)家托德埃斯克說(shuō):”沙漠越來(lái)越多,可再生能源開(kāi)發(fā)也越來(lái)越多。“高速公路和電力線(xiàn)會(huì)擾亂烏龜?shù)臈⒌亍N覀円苍诳紤]對(duì)整個(gè)景觀的變化對(duì)龜棲息地的影響。
“而且,在過(guò)去的100年里,我們已經(jīng)有入侵的草進(jìn)入牲畜,可能大多是偶然的。紅色的雀麥和地中海草是我們?cè)谶@里的兩種主要入侵草。主要是紅色的燕麥的飲食實(shí)際上是一種糟糕的飲食對(duì)于小烏龜來(lái)說(shuō),他們的生存率要低得多。“雖然Esque沒(méi)有參與該項(xiàng)目,但研究結(jié)果可能有助于龜保護(hù)工作。
二十多年來(lái),政府機(jī)構(gòu)和其他研究人員一直在監(jiān)測(cè)西南部的烏龜種群。莫哈韋沙漠龜種群的棲息地大幅減少,包括加利福尼亞州,內(nèi)華達(dá)州,猶他州和亞利桑那州。根據(jù)美國(guó)瀕危物種法案,該物種被列為“受威脅”物種,被國(guó)際自然保護(hù)聯(lián)盟(IUCN)認(rèn)為是“脆弱的”。
該項(xiàng)目的亞利桑那州立大學(xué)研究員Marc Tollis說(shuō),基因組是保護(hù)Gopherus agassizii龜?shù)闹匾Y源,特別是因?yàn)檫@一群體患有嚴(yán)重的疾病。研究人員還沒(méi)有完全了解其原因或是什么使龜易受它影響。
“我們不知道烏龜是如何處理它也受到上呼吸道疾病威脅的事實(shí),”Tollis說(shuō)。“解碼這個(gè)基因組將幫助我們編制哪些龜基因正在快速發(fā)展以幫助他們克服這種威脅。”
Tollis是一名博士后研究員,與該論文的資深作者Kenro Kusumi一起,獲得了特定烏龜標(biāo)本的遺傳數(shù)據(jù),匯集并注釋了基因組,并了解了陸龜?shù)倪M(jìn)化史。
“解碼基因組在技術(shù)上變得更加容易,”該項(xiàng)目的高級(jí)研究員兼亞利桑那州立大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授Kusumi說(shuō)。“現(xiàn)在最具挑戰(zhàn)性的是解碼烏龜基因組中的信息。我們可以利用與小鼠和人類(lèi)基因組相似的線(xiàn)索。在大海撈針中尋找眾所周知的”針頭“將是識(shí)別指導(dǎo)免疫應(yīng)答傳染病的基因,以及在莫哈韋沙漠的惡劣條件下生存的能力。“
Kusumi補(bǔ)充說(shuō),研究團(tuán)隊(duì)必須了解烏龜多樣性在其地理范圍內(nèi)的位置。確定遺傳多樣性的熱點(diǎn)有助于從保護(hù)的角度管理物種,并保護(hù)龜類(lèi)種群,以便在未來(lái)幾年內(nèi)更好地應(yīng)對(duì)未知挑戰(zhàn)。
合著者和亞利桑那州立大學(xué)博士后助理Greer Dolby正在分析這只烏龜與其姊妹物種索諾蘭沙漠龜之間的遺傳差異。
杜比說(shuō):“我希望這項(xiàng)研究能夠讓其他機(jī)構(gòu)提出新的問(wèn)題,如果沒(méi)有這項(xiàng)研究,他們就無(wú)法提出這些問(wèn)題。例如,'龜有什么免疫基因可以對(duì)抗病原體?他們的免疫力如何?系統(tǒng)在具有大量威脅的環(huán)境中運(yùn)行?并且,不斷變化的環(huán)境如何影響這一點(diǎn)?這些是管理物種時(shí)要回答的重要問(wèn)題?,F(xiàn)在,我們可以開(kāi)始調(diào)查。“
適應(yīng)惡劣沙漠中的生活
生活在研究現(xiàn)場(chǎng)的許多陸龜都配有小型GPS裝置。這使生物學(xué)家能夠知道他們?cè)谀膫€(gè)地方以及他們?cè)谀硞€(gè)季節(jié)旅行了多少。科學(xué)家定期檢查龜?shù)恼w健康狀況,身體狀況以及疾病或壓力的跡象。
從10月中旬開(kāi)始。到了11月,陸龜冬眠,只有在下雨時(shí)從洞穴里出來(lái)喝水。當(dāng)三月天氣變暖時(shí),它們會(huì)再次活躍起來(lái)并在春季交配。根據(jù)天氣情況,女性每年最多可以產(chǎn)三次雞蛋。
令人難以置信的是,沙漠龜在野外可以存活50年,壽命估計(jì)在30到50年之間。眾所周知,被囚禁的龜可以長(zhǎng)達(dá)100年。
掠食者包括烏鴉和土狼,但氣候變化,入侵草和人類(lèi)活動(dòng)等其他因素也會(huì)對(duì)烏龜種群產(chǎn)生負(fù)面影響。
在保護(hù)中使用基因組信息
沙漠龜?shù)奈磥?lái)不確定,因?yàn)樗^續(xù)面臨多重威脅。
“在最好的情況下,我們與ASU合作將有助于我們了解如何通知旨在增加保護(hù)并使該物種的生存永久化的科學(xué)方法,”Esque補(bǔ)充道。
基因組為許多研究提供了一個(gè)起點(diǎn),這些研究的重點(diǎn)是抗病性,對(duì)沙漠環(huán)境的適應(yīng)性,遺傳多樣性在其范圍內(nèi)的分布以及與其姐妹物種的雜交。
最終,來(lái)自解碼的烏龜基因組的見(jiàn)解應(yīng)該有助于指導(dǎo)如何管理這種受威脅的物種,并可能提高其長(zhǎng)期生存的機(jī)會(huì)。
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