單分子磁性鑷子揭示雙功能基因調(diào)控的事實(shí)
在真核細(xì)胞中,線性基因DNA纏繞在組蛋白形成穩(wěn)定的核小體,進(jìn)一步組裝形成染色質(zhì)。核小體是大障礙RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄機(jī)器。在基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程中,核小體必須先暫時(shí)移除然后之后迅速恢復(fù)。一個(gè)因素被稱(chēng)為促進(jìn)染色質(zhì)轉(zhuǎn)錄(事實(shí))使RNA聚合酶在染色質(zhì)的伸長(zhǎng)。但事實(shí)執(zhí)行這個(gè)關(guān)鍵函數(shù)的機(jī)制仍知之甚少。
單分子磁性鑷子已經(jīng)成為一個(gè)強(qiáng)大的工具來(lái)進(jìn)行動(dòng)力學(xué)研究核酸acid-protein復(fù)合物。通過(guò)施加張力染色質(zhì)、磁性鑷子可以用來(lái)研究解構(gòu)的染色質(zhì)的結(jié)構(gòu),從而產(chǎn)生強(qiáng)迫每個(gè)染色質(zhì)的光譜指紋特征。李偉和李明教授從中國(guó)科學(xué)院物理研究所最近的時(shí)間和空間分辨率提高了自主研發(fā)的磁性鑷子。
與陳平教授李Guohong和合作的中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所,他們研究了核小體的動(dòng)力學(xué)和染色質(zhì)纖維存在的事實(shí)和破譯的角色在重建核小體和染色質(zhì)纖維在單分子水平。研究人員發(fā)現(xiàn)這一事實(shí)不僅動(dòng)搖了核小體結(jié)構(gòu),協(xié)助通過(guò)聚合酶,而且還提高了可逆性的核小體的形成。
在事??上,核小體是完全展開(kāi)緊張低于8 pN,遠(yuǎn)低于了核小體在缺乏事實(shí)(~ 15 pN)。同時(shí),核小體不能重組他們的完整結(jié)構(gòu)缺乏事實(shí)的情況下,由于組蛋白的分離DNA。然而,核小體可以重組存在的事實(shí),這表明事實(shí)的附加功能的拘束組蛋白DNA以重新組裝完好無(wú)損核小體結(jié)構(gòu)。
事實(shí)進(jìn)一步證明了的雙功能通過(guò)兩個(gè)單元之間的協(xié)調(diào)SSRP1 SPT16。這些發(fā)現(xiàn)提供分子細(xì)節(jié)事實(shí)和核小體之間的相互作用。這些發(fā)現(xiàn)表明,事實(shí)中扮演著重要的角色在更換導(dǎo)線核小體保護(hù)組蛋白在DNA的DNA聚合酶通過(guò)DNA轉(zhuǎn)錄。
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