Near-atomic埃博拉病毒蛋白質(zhì)的分辨率模型帶來更清晰的理解病毒力學
沖繩研究所的研究人員科技研究生院(OIST)第一次成像中心的結(jié)構(gòu)組件near-atomic埃博拉病毒的決議。這項研究發(fā)表在《自然》雜志上,是由教授馬提亞狼和第一作者博士Yukihiko杉OIST分子低溫電子顯微鏡的單位(MCEMU)與世界知名的病毒學家合作教授喜田島Kawaoka(東京大學和威斯康星大學麥迪遜分校),北野田佳彥教授(京都大學)和結(jié)構(gòu)生物學家Hideyuki Matsunami博士(OIST)。
研究人員關注的一部分病毒核衣殼(NC),一個復雜的蛋白質(zhì),作為病毒遺傳物質(zhì)的支撐結(jié)構(gòu)。這個結(jié)構(gòu)允許病毒復制其致命的有效載荷,毀滅性的效果。杉田博士孤立nucleoprotein-RNA復合物,使nc的核心,高度的純度,然后分析它們與低溫電子顯微鏡(低溫電子顯微鏡)一起整日看它們的結(jié)構(gòu)。
“在這項研究之前,我們只知道數(shù)控結(jié)構(gòu)的最小的部分,“杉田博士說,“現(xiàn)在,我們可以看到它作為一個整體,它可能有助于發(fā)現(xiàn)抗病毒藥物的目標。”
完整的埃博拉病毒是一種微小的無形的絲狀結(jié)構(gòu),似乎是受到了短鏈的頭發(fā)當放大數(shù)千倍。在這些纖維碎片組成功能病毒:數(shù)控和基質(zhì)蛋白,由表面糖蛋白和病毒包裝信封。
但OIST科學家和公眾在任何危險的研究:NP-RNA復雜生產(chǎn)沒有任何實際病毒RNA序列在非感染性細胞生長在biosafety-laboratory OIST,并不代表任何風險。“這就像一輛車的部分,”沃爾夫教授說,“除非底盤、發(fā)動機、車輪等都在一起,沒有效果。這就是我們研究的粒子是最喜歡的組件是缺席。它是無害的。”
先前的研究已經(jīng)分析了數(shù)控結(jié)構(gòu)使用一種稱為電子斷層掃描的技術,但產(chǎn)生的低溫電子顯微鏡重建OIST團隊已經(jīng)高得多的定義,解決個人RNA的核苷酸和氨基酸側(cè)鏈。“我們的論文顯示首次near-atomic分辨率數(shù)控結(jié)構(gòu)是什么樣子的”狼教授說。
加強團隊的了解,想象看你最喜歡的電影。如果前面的學習就像在VHS觀看這部電影,他們的小說結(jié)構(gòu)就像看到4 k表示:細節(jié)遠遠更清晰,清晰的定義,允許科學家們還得到最詳細的圖片這個組件的病毒。
這是一個緩慢的過程實現(xiàn)這張照片,然而。“蛋白質(zhì)復合物非常脆弱,”杉田博士說,“一個完整的示例非常棘手。”
一旦樣本準備,團隊超過18個月才找到正確的方式來重建數(shù)控作為數(shù)字模型。蛋白質(zhì)復合體的螺旋結(jié)構(gòu)看似簡單,但是它有一個好復雜性。在精確的數(shù)量和對稱的螺旋的幾個小蛋白質(zhì)構(gòu)建塊可以使整個模型。但系統(tǒng)的搜索后,幾個提示另一個團隊的出版物提供的,和自己的高分辨率分析所提供的新的見解,OIST團隊的辛勤工作得到了回報;一切開槽。
“現(xiàn)在我們有一個明確的這種結(jié)構(gòu)是什么樣子的,”沃爾夫教授說,“它是更進一步弄清楚整個病毒是如何工作的。”
生成的三維模型從低溫電子顯微鏡圖像為未來的工作提供了準確的基礎。研究人員現(xiàn)在將能夠精確定位研究埃博拉病毒數(shù)控的整個結(jié)構(gòu),這可能戰(zhàn)勝病毒的方法。
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