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        科學(xué)家通過(guò)RNA測(cè)序破譯鼓槌樹(shù)的轉(zhuǎn)錄組
        
			
        
				2019-05-11 11:30:12
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			  來(lái)源：
			
        
		
        
				
		
        
			
        你有沒(méi)有想過(guò)為什么我們的祖母堅(jiān)持在房子前面有一個(gè)Tulsi植物(圣羅勒)和在后院有一棵Moringa(鼓槌)樹(shù)?鼓槌樹(shù)的每一部分都具有藥用價(jià)值，是營(yíng)養(yǎng)和礦物質(zhì)的豐富來(lái)源。傳統(tǒng)上，已知它具有抗糖尿病(葉)，心臟保護(hù)(根)，抗生育(根)，抗炎(根)，抗微生物(根)，抗氧化(葉，花) ，抗肥胖(葉子)性質(zhì)，并且還用于水凈化(種子)，以及作為潤(rùn)滑油(種子)，以及其他益處。
        

        科學(xué)家通過(guò)RNA測(cè)序破譯鼓槌樹(shù)的轉(zhuǎn)錄組
        

        由班加羅爾國(guó)家生物科學(xué)中心(NCBS)的R. Sowdhamini教授領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)科學(xué)家小組最近通過(guò)對(duì)來(lái)自五種不同組織(根，莖，花，種子和葉子)的RNA進(jìn)行純化和測(cè)序來(lái)破譯轉(zhuǎn)錄組。這個(gè)“神奇的樹(shù)”。樹(shù)木組織來(lái)自班加羅爾農(nóng)業(yè)科學(xué)大學(xué)的Gandhi Krishi Vigyan Kendra校園。使用計(jì)算算法和濕實(shí)驗(yàn)室方法的組合分析測(cè)序數(shù)據(jù)。這項(xiàng)工作的部分資金來(lái)自印度生物技術(shù)部的資助，部分資金來(lái)自印度SERB-DST授予Sowdhamini的JC Bose獎(jiǎng)學(xué)金。最近，Genomics期刊發(fā)表了一份完整的報(bào)告。
        

        辣木葉，花和豆莢通常被消耗。這項(xiàng)研究表明，這棵樹(shù)的葉子含有的鐵含量是菠菜的30倍，鈣的含量是菠菜的100倍。“事實(shí)上，發(fā)現(xiàn)這種樹(shù)的根部和莖部的鐵，鋅和鎂轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白非常豐富，”該論文的第一作者Naseer Pasha博士說(shuō)。在研究的所有五種組織中，維生素C產(chǎn)生所需的關(guān)鍵酶之一也以顯著比例表達(dá)。
        

        這種喜馬拉雅山脈的樹(shù)木很少受到關(guān)注，可以在干旱地區(qū)生存。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明多種應(yīng)激反應(yīng)基因，如C2H2和Myb基因家族?？傊?，它提供了令人信服的證據(jù)，證明這種植物是一種“超級(jí)食物”，可以在干旱期間提供營(yíng)養(yǎng)支持。
        

        在這項(xiàng)研究中，從所有五種組織中共追蹤了36個(gè)候選基因。這些包括化合物的合成酶(類(lèi)黃酮，萜類(lèi)化合物，維生素和生物堿，如Moringine)和礦物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。其中，在葉子和花中更多地觀(guān)察到具有藥用價(jià)值的生物活性化合物，例如槲皮素(在代謝紊亂中有效)及其合成酶。觀(guān)察到山奈酚(作為抗癌劑有效)在花中很豐富。能夠合成通常在細(xì)菌中觀(guān)察到的Moringine /芐胺的酶的轉(zhuǎn)錄物在辣木種子中高度表達(dá)。Moringine可能被運(yùn)輸?shù)礁坎⑶乙阎梢愿纳撇溉閯?dòng)物的葡萄糖耐量和脂質(zhì)代謝。熊果酸和齊墩果酸產(chǎn)物和合成酶在根中觀(guān)察得更多，并且已知其作為抗生育劑和抗癌劑。“已經(jīng)觀(guān)察到總共17000個(gè)轉(zhuǎn)錄本，這是鑒定候選基因的生物信息學(xué)挑戰(zhàn)，”該團(tuán)隊(duì)的Adwait Joshi博士說(shuō)。Sowdhamini的小組將數(shù)據(jù)與現(xiàn)有數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較和比較來(lái)自中國(guó)一組的辣木基因組序列(Tian et al。，2015)。
        

        “揭示賦予辣木藥用價(jià)值的酶的細(xì)節(jié)，證明了基因組學(xué)的力量。與商業(yè)應(yīng)用一起，例如在水提純中使用辣木葉和油提取物中的油酸，這項(xiàng)研究可以鋪平這種植物在生物技術(shù)領(lǐng)域的發(fā)展方式，“Row Sowdhamini教授說(shuō)。與Tulsi上的論文一樣(Upadhyay 等，2015，doi：10.1186 / s12870-015-0562-x)，這是研究小組再次嘗試解開(kāi)印度藥用植物的奧秘。
        
			

			
          
        
			
        
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