抗生素抗性可以在土壤細菌中自然發(fā)生
自20世紀40年代以來,抗生素已經(jīng)有效地治療了某些細菌性疾病。但多年來,一些細菌已經(jīng)對曾經(jīng)殺死它們的抗生素產(chǎn)生了抵抗力。根據(jù)美國疾病控制和預(yù)防中心的數(shù)據(jù),每年,美國約有200萬人感染了抗生素耐藥細菌。雖然抗生素耐藥性通常被認為是人類和動物過度使用抗生素的結(jié)果,但情況并非總是如此。Lisa Durso是內(nèi)布拉斯加州林肯市農(nóng)業(yè)研究局(ARS)農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)管理研究小組的微生物學(xué)家,他最近在草原土壤中發(fā)現(xiàn)抗生素抗性細菌,這些細菌很少或根本沒有接觸過人類或動物。
Durso屬于全國范圍的ARS科學(xué)家網(wǎng)絡(luò),負責(zé)調(diào)查與農(nóng)業(yè)相關(guān)的抗生素抗性,分享關(guān)鍵信息并開發(fā)解決方案。他們的研究涉及檢查與食品安全,動物生產(chǎn)和保護以及環(huán)境有關(guān)的抗生素耐藥性。
在抗藥性方面,科學(xué)家通常會測量三件事:藥物(人們服用或給予動物的抗生素),“蟲子”(可能具有抗性的細菌)和基因(編碼抗性的細菌中的DNA指令)。Durso解釋說,基因通常存在于細胞中,但并非總是如此。細胞死亡后,基因可以存留在土壤中。
“抗生素抗性細菌和基因天然存在,”Durso補充道。“研究顯示土壤樣品中的抗生素抗性可以追溯到猛犸象的時代。這是因為抗生素,如青霉素,最初來自真菌或其他細菌 - 天然存在于土壤中。”
根據(jù)Durso的說法,確定農(nóng)場和環(huán)境中抗生素抗性來源的一個障礙是測量。在添加了糞肥的土壤中(通過動物或通過傳播)中發(fā)現(xiàn)的抗生素抗性細菌和抗生素抗性基因提供了關(guān)于樣本位點(例如飼養(yǎng)場)中當前存在的有價值的信息。值得關(guān)注的是,即使糞便中的細菌死亡,它們的基因也可以存留在土壤中。如果沒有收集抗生素耐藥性的基線水平,那么科學(xué)家將難以從自然發(fā)生的耐藥性中挑選出人類抗生素使用引起的耐藥性。
“為了確定食物 - 動物抗生素使用對抗性的影響,在測量農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)的抗性時,必須考慮并減去基線的抗性水平,”Durso說。
為了解決這個問題,Durso和她的團隊研究了過去20年來沒有人類影響且沒有動物放牧的原生草原土壤。該團隊與眾多合作伙伴(包括土地所有者,學(xué)術(shù)界人士以及州游戲和公園委員會的工作人員)合作,確定內(nèi)布拉斯加州東南部的20個原生草原符合這些標準。
從這些地點收集土壤樣品并篩選抗生素抗性細菌。所有樣品都含有對四環(huán)素和頭孢噻肟具有抗性的細菌,從草原土壤中分離出的近一半細菌對兩種或多種抗生素具有抗性。
“我們實際上測量了土壤中的總DNA,并分離出了所有的DNA,我們認為這些DNA主要來自活細胞,”Durso說。
該發(fā)現(xiàn)還包括91%的樣本中的一種磺胺類抗生素基因。被認為是人類活動的標志物,盡管在這些位點缺乏人類活動,但該基因仍然存在。
“其他研究表明磺胺類抗生素基因與人類活動有關(guān),可以作為測量的基礎(chǔ),”Durso說。“然而,我們的研究結(jié)果表明,如果我們在內(nèi)布拉斯加州的飼養(yǎng)場看到磺胺基因,我們就不能斷定這是由于人類活動,因為我們在這些草原上看到它們的數(shù)量相當多。”
Durso補充說,非常需要降低農(nóng)業(yè)環(huán)境中的抗生素耐藥性??茖W(xué)家需要確定的第一件事是減少的現(xiàn)實目標 - 他們可以測量的低水平?這些發(fā)現(xiàn)為回答這些問題和實施降低農(nóng)業(yè)生產(chǎn)抗生素抗性的策略提供了基礎(chǔ)。
“我們希望農(nóng)場能夠?qū)股禺a(chǎn)生零抗性是不現(xiàn)實的,因為即使在自然環(huán)境中,你也會看到阻力,”Durso說。“我們能夠利用這些數(shù)據(jù)為自然發(fā)生的情況設(shè)定基線。它為我們找到了如何最好地管理農(nóng)田抗生素抗性的起點。”
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